EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33399 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:40325925-40327397 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr3:40326408-40326419AAGAGGATTAA+6.14
GRHL2MA1105.1chr3:40326801-40326816TCCAAACCAGTTTCA+6.14
HSF1MA0486.2chr3:40326394-40326407GAATGTTCCAGAA-6.67
HSF2MA0770.1chr3:40326394-40326407GAATGTTCCAGAA-6.71
HSF4MA0771.1chr3:40326394-40326407GAATGTTCCAGAA-6.62
IRF1MA0050.2chr3:40326805-40326826AACCAGTTTCAGTTTTTTTCT+6.28
SOX13MA1120.1chr3:40326009-40326020AGCCATTGTTT-6.14
Sox6MA0515.1chr3:40326011-40326021CCATTGTTTT+6.02
YY1MA0095.2chr3:40327297-40327309GCAGCCATTTTG-6.52
Enhancer Sequence
AAACCTGCTC GCGGCCCCAA AACCTCCCCG CAGAGCCCCA AGGAACTGGT CAAAGCCAAG 60
GAGGTGAAAG ATCCCAGCAA GGTAAGCCAT TGTTTTATTG ATATATCTCA AATCTTGCTT 120
GCCAGCCACA ACCAAACGGT ATGGGCGCTT GATACCACCA GCAGGTGTCC TGCTACATTT 180
GTCGGACAAG GAAGCCTCCC GCTGTGAGTG TCATGTTGTT GGACACAAAA GGATGACTGC 240
AGCTTGCCAG GCTACAATTA CTAACCATCA CCATTCCTCC CTCCGAGTCC TCCCGTGTTT 300
TTCCTTTCTC TTAAGTGTTC AGTACACGGC TGCCTATTAA TGTTTACTTG TCTATCCAGT 360
GTTGTTGAAT GGCTGTAATG TCTGGGAGAA CTGAGCCCGA TTGTGTCAAG CATTTGTATG 420
AGGCTTTTCA CTCTTGTCCA TGCTGATGGT TTGTCTTTGT ATCTGGTGTG AATGTTCCAG 480
AAGAAGAGGA TTAAGGAGAC CCCCCTGTGT CTGCCCCCAC CCCAGCTCTC CAGCACACCC 540
TCAGAAACCA GCGGAGCTCT CCCTGTCAGC CCAGGACGCA AGAACAAGGT CCAAAAGCCC 600
AAAGCCAGAG AGGTAAATAT TACCGTGTTC AACAGACATT CAATGCCAAG TAGTGATAAG 660
TTGGATGATA TTGTACTGAT ATGTAACGTT TACTGTTATA TAGCATTATC GTGAATTTGT 720
TTTATTTGTT TTGTATTAGT ACATTATAAT TCAGGAGCTA AGGTACGAAT ATATTAAAAT 780
TTAGTGGGGC TCAGTGGGGG ATTTATACTT TTATTGATGG TATAGTTGAC CCTTAAATTA 840
ACATCCCACC ATCATATTTT CTCAGCCACC ACATGTTCCA AACCAGTTTC AGTTTTTTTC 900
TTTTGGTAAA TGCCAAAAAA TTGTAAACAT GCTTTAAAAT ATTGTTTTGT AACCGAAAAA 960
AATAAAGTCT TAAAATAACT TGAGGTGCCA GTAAGGATAC TCATACTTTA GACACAAACA 1020
TTTCTTGTTT TTTCTTAAAA CATTAAGCTT TAAACTGATT TAAATCTTTC CATCATAGGA 1080
ATAAATGACA TTTAAAAATG TATTTAAATA GAGAATGATT GTTATAATAA GCTGTCATAG 1140
TGATATTATT GTAACAAATG TAAATAAACC AAATTAAACT AACTCCTTAA AAATCCTACT 1200
GACTCTTAAA CTTTTTGGTA TAAAGTATAT TATACTCTAA AACACACACA TCCCACTGTA 1260
GATTGTATTT TGTTGTCTGC TTTCACACTC TTACTCGATA AAATACATGA TGCATTGTGT 1320
TAGCTCTCAT TTTTAGCATG CCAGTAAAGA ATTATTTGAA AGCTAGCTTA GAGCAGCCAT 1380
TTTGTGCTAT GCTGAAACAC CGAAAGGGAT TAGAATAATT TTACCTGGCA GGCCCGAGGC 1440
CCACTGGGAG AGAAGCCTTG CATTTAAATG AG 1472