EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33393 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:40279145-40280449 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr3:40279315-40279326AAATCACAGCT+6.14
LEF1MA0768.1chr3:40279295-40279310AAAGATGAAAGGGTC+6.05
MecomMA0029.1chr3:40280188-40280202TCTTATCTTGTCAA-6.06
POU4F1MA0790.1chr3:40279221-40279235TATTAATTATTCAT-7.25
POU4F2MA0683.1chr3:40279219-40279235ATTATTAATTATTCAT-6.6
POU4F3MA0791.1chr3:40279219-40279235ATTATTAATTATTCAT-7.15
Enhancer Sequence
TTTATTTTCC AAATGTGATT CTGATTTGCT ACTTTCACAT TTGTCTATTT TTTTGTTCAT 60
TTATTATTAT GATGATTATT AATTATTCAT TGCAGTAGCA TTCCTCCCCT CTCCTGGGGC 120
GTTTGTCATC ATGTGCTAAT TTGTCTGAGG AAAGATGAAA GGGTCAGGTG AAATCACAGC 180
TCCCTGTGTA ATATATCAGG AATGGTGGGA TCTCCCATTT GGACACAAAG CCTTATTTTC 240
CATGTCACTG ATGTACAATG TTGTTCTTGT GTAATGAAAA GGTGATGAGC AGCTTTTCCT 300
CGGCGCAGAT ATTAATGTTA GTAGGGCAGC ACGTCACGTC ACGCAGCTGT TTGAAGCAGA 360
TACGACGAGA AAGCCTCTAC ATAAAACTGA GCCTCCTCTG TGTGTTTATT TCATGGTGCG 420
TTTCAAGTAA TTGCATAGAA ATTGCAACGA GTTTCATCGC ACACGCGCGT CGCTACTTAG 480
CCACAAGGTC ACGGCTCTGG TCGCTTGGCA GCACCTTAAA AAGACACGCT GTGAACAAAT 540
GCTACTTTTG TAACTTCAAC AGCGCTCCGT CTTGAAAGGA AGGATTGAAT GCTGACGGTC 600
GCAAATGTGC TTGACCTTTC TATTGCTGGC TCATGTTTCT GCCTCTCATG GTAACCAATC 660
AGGCTTTAGG TGGAGCTCAA AGGAAGACAG CAATAGAACA AACACCTTTT TTTTAGGCTA 720
TAGATTTACA CGAAGCCTTT GTACTTGAAG TCTGCTTAAA TAATAAAGGA AATCACCTTT 780
TGTACTGAAT CGCATTTAGT TCCCTTGTGC TTATTTTATT CTGCATGCAA AGCTAAACAT 840
TCACCATTGT GTACAACAAA GGGCCATGTA TAATCCTAGC AGTTTTCCAG GATGAATTCC 900
TGCCCAGACG CATTGTTTAA CACAGTTGTA GGTTTGGTTG TTGAATAGGC AGTGACGCCT 960
AAACTTGACG CTCAGAAGCT TGTTTATTAG ACAAAGATTA CCTCAGTATG TTGGATTCAC 1020
CGCTATAGCA ATTATTTTGT CACTCTTATC TTGTCAAAAC ATCTTAACAA AAGTTTCAGT 1080
TTGAGCCCTG CAGTGTGAAG GAATTCGGTG TTTTGTATGA GATCCAGGTT GACTTGTTAG 1140
AACTGGTACA TCTGACGTGT TTTTGTTTCT TCGCAGGTGA TGCATTGAGC TGAGGTAGAA 1200
TGCCAAATTA CTCGTTTTCC ATCAGCCCGT ATAAACGCAC CAAACGTGAT GGATAGGAAT 1260
CCGCACAAAA ATAACTCTAA ATCACTAAAA GGAGATTTGC CAAA 1304