EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33390 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:40267445-40269775 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr3:40269700-40269711TTTTATGGCTT-6.62
CrxMA0467.1chr3:40268997-40269008TTAATCCTCTT-6.14
FOXE1MA1487.1chr3:40268730-40268745CATTAAACAAACAAC+7.66
Foxd3MA0041.1chr3:40269689-40269701GTTTGTTTGTTT+6.32
JUNMA0488.1chr3:40267632-40267645ATAATGATGTAAT+6.32
JUND(var.2)MA0492.1chr3:40267631-40267646AATAATGATGTAATG+6.04
NFE2MA0841.1chr3:40269331-40269342GATGAGTCATT-6.32
NFE2L1MA0089.2chr3:40269328-40269343TTTGATGAGTCATTC-6.37
SOX21MA0866.1chr3:40268071-40268086AACACTACAATTATT-6.43
ZNF384MA1125.1chr3:40268990-40269002TTTTTTTTTAAT-6.74
Enhancer Sequence
CACCACAGTA AGTGCAGTTT TAATTTCCCC CCTTTAAAAA TGCGCTTTTA AAGAAGTGAG 60
AAACGCACAA AAAGGAAAGC GCTTTCCTTT TCTTTCAGAC TTTTCTCTCC AGTGCTCGCT 120
ATTTCATATC GCTGGATATG GCTTTGGGTA AACATGGGAA AGGAAATGAT CATGTTTAAT 180
AGGGTTAATA ATGATGTAAT GCGTCGTTTA TTTAACTATA TAAGGATGAT GTTGTGTGTA 240
TAAAATCCGT GTAATGTTGA TTCACCTTAA ACACTACAAG CAGAACTCGC GTTCATCTTC 300
AGGTCGGCTA CAAACGCTTA TACGCGTGTA GTTGTAGTGA AACATTTCTG CGAGCAGTTG 360
TTTTTAAAAG CAGTGTAGTT TCACCCCAGA TCACCGTACA ATCCTTCACT CGCCCGCGAA 420
CAGTTCTCAA GGAAAATGCT AAAACTGTGG AAAGTAATGC GTGTTGGCAC ACGTTAAATA 480
ATTCAGCTGC TGGAGTAAAG CACGAGGTGT GTTTTGGCCA AAAGACCTAA TGTTTTAACT 540
AGGAACCATT GAAAATCGAC AGCATGGATT CATGACTGAA ATTGCCCCAT TTGTTTTCCA 600
TCACTCCCCC TCCACTGACT GGGGCAAACA CTACAATTAT TGCTCTTCTC GAGTGAACTA 660
TTGCTTTCCC TGTCACCTCA GCTCCGACCC TTGTGCTCAG AAATGCTCTT TAAAGTCCAG 720
ACTGCGTATT AAAGGAAAGT ATGATTGCAG AGATGCAGCT TTAAATGTAC GTTTAGATCT 780
GCAAATGTTA TGACCCAGTC TGAATACATG TAGTTGATTT TACAGTAACG TGTTGATATG 840
TTCTATTGTC ATGCGGTTTA GTCATTTATT TAGTATTTGT TGCTTAATTT AAGAAACAGA 900
TCTTTATATT GTGGTCATTA TAAGATGACT AATGTGTTGC ACAATCTATG TTGAAAAAGT 960
CATACTTAAT GAGCCTTTTC AGGAAAAGAA TCCACTAATT TGTACTCCAT ATAGGCGTTG 1020
GGCCTTACTT TACTGTTTAA TTGGAAGCTA ATGAGAACAT TGTGTTGTTA TTTCTCTTCA 1080
AGAATGCAAA AAATGAGTTT AGAGAAAGTG TTATGTCTTT CTGCAGCTAA TAGATTGGAG 1140
TTTCTGTTAC TGTCTCTGGT GATTATTGTG AAACGGTTGT TTCTGTCATG TGCCATAATT 1200
AAAATGAATG TGCTGCTGTT AATATAATGC AGTAGTCACT GATGTTTATT GTTATAGTTG 1260
TTTAAAAGTC TAAACTGTAA GTCCTCATTA AACAAACAAC TGTCGAACTG TGTTAATGAT 1320
GCCATATAGA GTAACTGTCT GGTGTCTTGG GGCTGGATAC AATGCAAATT ATTTCAAACA 1380
AACATCAAGC AAATAACAAT CTATGTCAGT TTGTCATGAA ACAGAATAAT GCTTGAATTG 1440
TTTGTTAAAT AATTAAAATC TGATGTTTCA ATGTTGTCAT TTTAAAAGTA ATCGTATGGT 1500
ATTAACAATA TTTTGTAGAT TTTTTTTATG TATAGAGTCA CAGACTTTTT TTTTAATCCT 1560
CTTCAACAGA TGCAACACTG CTGATCTCAG GAGAGAACGC TTTTAGATCT CTGTGAAAAG 1620
GAGATTTGAC TTTGTTTAGG AGTGTTTAAG ATGTCAGCAG TTTACCATTC CTTTTTCTAT 1680
CTGCCTAAGA GAGCTTTGTA TTAGTAGTTG CCGCCCTTAC TCTAACCCTC GATTATGACA 1740
TTTTTACACC GTGTTGTTCG ATGTTTTATA CTGATAAGAT TTGGCTAGTG TAATAAATAA 1800
ATTGTTACTG CATCTGACAG TACCTTACCC TTATTGGATA ATTATCATTC AAAGATGATT 1860
GTTTTATTTG TATTGCCTTT AGCTTTGATG AGTCATTCAG TTCTTTGAAG AATAACAAAA 1920
AAATACACTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTA CACACACACA TACATGCATA 1980
TCTCTATCTT GCCATTTCTT GGGTGCACAA TCAATAGAAC CAAGACCTTC AAAGGGCATG 2040
TGGTGCGTTT GCTCATGAGC TCAAATAAGT GCTGTTGTTT TTTTTTCCTT AAAAATCTGT 2100
CAGTGTTAGT GCTAAAACAT TGTTTGTGCC ACAAACACAC CACATAGTGA AGTAATTGTG 2160
ATTCTGACAA CATGATTCAA GAGCAGTTAT CTTAAAAATG TACTCCTTCC AAAGTGGTTT 2220
TGAGATTGCC TTTCTTATTG ACATGTTTGT TTGTTTTTTA TGGCTTTTTT CATAAATGGT 2280
CTTCATGCGT AGTTGCAATA AGTAGCGGAT GCATCATATG TTTATGGAAT 2330