EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33339 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:39018813-39020113 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:39018964-39018985AAAAAGAAAACGAAACCTATT-6.19
IRF9MA0653.1chr3:39018966-39018981AAAGAAAACGAAACC+6.02
TCF7L2MA0523.1chr3:39019874-39019888ACACATCAAAGAAA+6.17
ZNF384MA1125.1chr3:39019060-39019072TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr3:39019061-39019073TTTTTTTTTTAA-6.44
Enhancer Sequence
TTTGTAAAGT TAGTAGTAAT TTGTAAAGTG GGCGTTATGC TCTAAAAGAG CGGGCCGCGC 60
CATTTTAAAT GATGCACTGA GAGAGCAGCG CGCGCAAGGA TCCGTTCAAA TAGATGTAAA 120
GTTAACACAT AGCTGTAGGT CTACATTTTT AAAAAAGAAA ACGAAACCTA TTTATCCGCA 180
TTACAAATAC AGTAACGTTA GTTATCGCTG AACTTTAGTG GCGCTTGTTG TGACGAAAAT 240
ATGCGTGTTT TTTTTTTTAA GATTTACTTT TATGAGATCA CCTGCAGGAA GCAGGTGAGG 300
AGATCAGCTG TGATTCGGTC CGGCGTCAGC GAGCGGCTCA TGACCAGACC AGTCGTTTTT 360
TTCTCCATGA TCGCCGGGGC AGCAGCAGTT TTAACCCGCC GAGGCTTTTT TTTGTCGTAG 420
GTAATTTAGA ATTTCGATGC GATTACGATT CGTGTCACTG TATGAGGCAG ATACATATTT 480
ACACATGATG CTAAAGTGTG CTTATGCTAA CAATCCCTAT GAAACTTAAA GTTAAACTTA 540
TGAAAATGCG AGAGATATTT AATTAACTCA TTTATTTGTT TTATATGCTA TTTGTCTTTT 600
CTTTATGCCG TTTTGAAGGT TTATTCCAGT GTTGCCGTTA CGTTGAGTGT TTTGTATTGC 660
TGTAATGACA AATAAATCTG ACCAGACGCG ACTGAATATG TGTGATGGAT AACGTTAATG 720
ATGAAGTGGT ATAACTCGTA CAACCAAGCA CAGAAACATC CCTTTGTTTG CTCAATATCA 780
AACAAAGGCA TCAACAAGCC TTTGTTATAA GCAAACTTTC TGTAAAGAAA CAGGCTTTGC 840
CAAACCTGTT AGTTTGCATT TTTAAAAAAG GTTTCACTAA TTTTTAACAA TTTAGGGCAA 900
ATAAATTTGA ACAATTACAA GGTTGTTTAA AATGTAGCAC ACCATTAGAG TATTGTGAGT 960
GGCATATTTG GTTTGTAATA TCATTATACC CTTTATTTAT TTTTTATTTC AGACTACCAG 1020
TTTGTGAGCT GATATGCAGT GGAAATGTAA GTTTTGCACT TACACATCAA AGAAAACTTT 1080
TTGAACAATA CCGCACAAGC CATAGAACAT ATTCATGAAT TGTTCTATTA ACGTTACCTT 1140
GTCTCCTTAC TGAGTGTCAG GGTAATTTTA AATCGTTTAA TGCATTAAAA GTACATTTAA 1200
CAAAATTCTC AGCAAAGAAC TGCATGATCA AGAATAGTCT GAATATTTTG TCCATTTGAA 1260
TAATCATCTG AGGACTAGTT AGAAATAGGG TTGTTGTGTT 1300