EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33239 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:36060472-36061530 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GCM1MA0646.1chr3:36060915-36060926CATGCGGGTAC+6.62
Nfe2l2MA0150.2chr3:36061193-36061208TGCTCAGTCATGCTG-6.78
Tcf12MA0521.1chr3:36060545-36060556CAGCAGCTGTT-6.32
Enhancer Sequence
ACCTGGCATA CTCAAGATTA AGGACAGGAA GAGACAGAGA ACTCAACAGC ATTCAGGAAG 60
GTCAGAGATG TCTCAGCAGC TGTTGTCGTG TCTACTCTTA TGTGTGCCCT GAGCCTGGCC 120
ACTGCCTTCA ACAGCAAAGA GCTTTTGCTG TTCAGCACTT TGCAGAAAAC ATCTTCCAGG 180
TCAGCTATTC CTGCGCAAAC TCAGGCAGTT AAATATATCT CCTGGCCTGA GCCGTCCAGC 240
GTGCGTTTCC ATTCTCACAT CATGACGGCT CTGACAAGCT CTATATTAAC AGGAATTAAA 300
AAAAGAAAAA TGCACAGCCT TGTGCTTCTC CATGTATGGA CTCGAAAAGG GAGTTTTTAA 360
CATGCTAAAA CATTCAAAGA CTAAAGCATA CAAGACATGG TTTCCTTTCC TCCATAAAAT 420
GCATGTACAC ACATGCACGT ATACATGCGG GTACCATTCT ACATGTAAAG ACATCAGCGT 480
GTATGCTAGT TCATGCTGTG CTAAATAAGG CTGGGAGTGG TTCAAGAGAC CCAGTTAGGA 540
GATGGAATGC ACGGGATGGC CCCTCCCCCA AACCCACTCC CCTCCGCACG CACCATCTGG 600
CCCGGGGTCC ATGTGATCAT AGAGAGCACA AGCGCTGAGA GGGAGGTGCA GACAGAATGT 660
CGGTCTGTCA TGGCATGGAT GCCATCGCAA CGTTTGGCCG CTGCAAAGTG AACGTCATGC 720
ATGCTCAGTC ATGCTGCGAG TGAGCGGACA GACTTGAGCG TGTTTGAAAG TGAGCGCTGT 780
AGACACACTT TTCCTACTGA CACCATAAAA CACCGCCTGA CAGGATGGTA ATACATCTAT 840
CCAGAATAAA AGCAATCACG GGTAAACCCA GCTGGATGCA GCGAAGGGGG ACGCATCCTT 900
CAGAAAACTC ATGTATATTC ATGAGCCATC ACTATGCATT GCAAGAGAAA CAAAAAGTCA 960
ACCAAAACAA ATATTATTGG GTCCAACTAC AGGATACAAA TGGCATATTT CTTCTTCATT 1020
CACATGAGAA TCCATGTTCA GCCATTGAGT ACACGAAA 1058