EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33232 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:35905213-35906621 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr3:35906538-35906554TGTTGCTATGGTAACA+6.83
RFX1MA0509.2chr3:35906538-35906554TGTTGCTATGGTAACA-6.83
RFX2MA0600.2chr3:35906538-35906554TGTTGCTATGGTAACA-7.04
RFX2MA0600.2chr3:35906538-35906554TGTTGCTATGGTAACA+7.09
RFX3MA0798.1chr3:35906538-35906554TGTTGCTATGGTAACA+6.99
RFX3MA0798.1chr3:35906538-35906554TGTTGCTATGGTAACA-7
RFX4MA0799.1chr3:35906538-35906554TGTTGCTATGGTAACA-6.32
RFX4MA0799.1chr3:35906538-35906554TGTTGCTATGGTAACA+6.75
RFX5MA0510.2chr3:35906538-35906554TGTTGCTATGGTAACA+7.37
RFX5MA0510.2chr3:35906538-35906554TGTTGCTATGGTAACA-7.3
ZNF143MA0088.2chr3:35906304-35906320ATCCCACGATGCATTA+6.3
Enhancer Sequence
TTGCTGCCTG AAGTGGTGTT ACTGAGACCG GCAAGGGGCG CTGAACCTGT GGTCTGTGTG 60
GATCCTAACG CCCCAATATA TTGTGAGAAA TTAATGAGTC TACCATGACC CAACTTCCAA 120
TTTAAATGAT GTGTTGATGC TCATTTAAAA GGGCTGAATT GTGAGATAAA AGAGAAGTCA 180
ACAGTTTGTG GTCTCTGCAT TGTTTTAGGT GACTACATCT TGACCAACTG GTAATCATTG 240
TAGAATGGGG ATGATGTGGT GCACAGAGAA CCATCTCATC AATGGTGTGT AACATGCATT 300
AACATTGAGA GCACAGCTGC TTCAACAGCC AAAAAGCAAC TTCATTAACA TCTAAAGGCA 360
AGTCTAAAGG CAACATCCAA AACAGTATAA AAGGTTTGAG TTTAAGAATG TTCAGGGTTC 420
ATTCTGATTC AAATGAAACC AGGGTACTGC CGTGTATTTT AAGACTGCTA CTCTGAATAA 480
ACATCTTCAT TAGTCTCTTA GTCGGCTTAG TCCCTTTATT AATCCGGGGT CACCACAGCG 540
GAATGAACCA CCAACTTATC TAGTATATTT TTTACGCAGC GGATGCCCTT CCAGCTGCAA 600
CCCATTTCTG GAAATTATCC ATACACACTC ATTCACACTC ATACACTACA GGCAATTTAG 660
CCAACCCAAA TCACCAGTTT TTGGACTGTG GGTGAAACCG AAGCACCTAG AGGAAACCCA 720
CGCGAACGCA GGGAGAACAT GCAAACTCAA CACCGAAACG CCAACTGACC CAGCCGAGGC 780
TAGAACCAGT GACCTTCTTG CTGTAAGACG ACAGCACTAC CTACTGCACC ACTGCGTCGC 840
TGGAATTATT ATTATAAAAA ATAAACAGGA AACATAGTGG CACTATTTTC TTTTCTTTTC 900
TTTTTTTTTG CATGTTTGTG TGCGGTGTAC TTAAAAAATC TAGTCACAAA ATAACTCCTA 960
TTGTTCATGA AGGATAGGAT GCTGTCTTGA ATTGCAGATG ACTACGTAAG AAGATGAGCA 1020
CACTAGCTGT TTTGGCAGAG CCTCTATGTG TATAATTTCT TAGTGTGTCA GCATGAGGCA 1080
CAATCCTCAT AATCCCACGA TGCATTACAG CCTTGTTACA GATTATGGAT TGAAGTGTCG 1140
CTCTCCTGAA GTGCCAAATT TGATAGGGGT CTTCACAATA ATATAAGGAT TATTTTAGCA 1200
GTTTTCATCA AACTCTGCCT CACACACACA CCTACTTGAA CACTCTATGC TTTTCCTGAG 1260
GGCCTCGGTT TTCCCACTCT GTCTGATAAC ACTCACAAAG ATGAGTAAAC CCTTGACTAG 1320
AGCACTGTTG CTATGGTAAC AGCTCCTTTG ATGAAGCCCG TCTCCAGATA AAGCTACTGA 1380
CAGACCAGGG TGATTAAAGA CACTCATA 1408