EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-33007 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:32117895-32118704 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:32118334-32118346GATTGTTTGTTT+6.92
IRF1MA0050.2chr3:32118243-32118264TCTCTCTTTCTCTTTCTAATT+6.14
MecomMA0029.1chr3:32118172-32118186TCCTATCTTGTCTC-6.07
Enhancer Sequence
TGCTTCAGCT TTTTTGTTCC AGCTTCTCCT GAATGTCAGT GGTCACCAGC AAAAAAATGT 60
GACCCAAGCA TATCCCAGGA CAAGTTCTTT TGACCCAATC AGAATGAAGA CGCAATATAA 120
ACGAATCATC AAGAGACTTC CAAGCCAAAC AAAGAGACTC TGCGAGTATA ATTTAGATAT 180
CAGATATATA ACATACATTT TTTTGTTAAA ACAAGGGGAT TCAGATTTGT GTGATGATCT 240
GTTTTGGGTT ACTGATGTTG AATTGCAACT CACTCACTCC TATCTTGTCT CTCTGGCTTC 300
TTGGCGGAGT TTCTGGCCAT GCTCTCCCTG AGTCTCTGCC CCTCCCCCTC TCTCTTTCTC 360
TTTCTAATTA TATGCAATTT GTAAATAGAT GTATAGTATC TAGTACTGTA ATTGTCATTA 420
AATGTTTGTG CCCACATTTG ATTGTTTGTT TTCACACATA CAGTAAAAAC GGTTATTTTA 480
ACCTATAGAT AATGCTTCAT GCAAAAGTTA CATGGTGCTA TATTAATTGT TAACTCGGTA 540
GAGATTCAAT TATTCTTCCT GGACAGAATA GTTATTTGGT CTGTATTAGA CAGTTACATG 600
GTTCGCTCGC AGATGTGCAG GAGTGTGTTT CCCAAACAAC GACATAACTT GTGGCTGAAC 660
TATCATAATA CGATGCATCA TTTTGGAATG AATGATGTAG TGACGAGTGT TTCCCAAAAC 720
AGTAGCTGCT TTGTCGCAGA TCCATTATTT GAGCCACATT GGTTATAACG TAAAACGGCC 780
ATAATGACAC TTCAAACTTG TTAGGTGGA 809