EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32968 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:30753840-30755536 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:30754879-30754900AAAATGAAAAAGAAAGAAGTG-6.48
ONECUT3MA0757.1chr3:30753878-30753892ATAATTGATTTTTC-6.01
RARAMA0729.1chr3:30754619-30754637CCGTGTCCTGTTGACCTC-6.03
Enhancer Sequence
CTAAACAACA ACACTAATGA TTGCATGCAG GTCAGCTGAT AATTGATTTT TCCCCATTTA 60
TAACTGTCGA TTATTATTTG TCAGTCTTGG GGGACATGTG TCACTGTCAG GAAGTCGAGT 120
TAACGGACTT CACCCAAACC TTTCGGGTCC AGTTAGCTCG CTGGACAACA TAAGCAGATC 180
CACTCGGTCA AAGTTAAAGC ATTAAACGCG ATATATGTTG ATTACTTCGA ATTTAAAAAA 240
ATATATATTA TCAAAAGGGT GGGAGCATAA GCTAAAGATA TTGTAAAATA AAGAGCAGAA 300
AATATTTACC TGACGGGCTT TACTTGAAAT TTCAGGTCGA TTTGTCCGTA GTAAAATTCG 360
TCTGAAAGCT AGCAGGCTAG CTTTTCCTGT TGGCTACGAC CGTCGCTGCC ATCTGCTCCA 420
GCTTTTCCCA TAATCCATGC TTTAACTGTC CTCCCGCGCT TTAATGACTA CAACATTAAT 480
AAATGCACGG TCTGGATGAA ATGATTTGCG TAAAATACGA ACATTAATTT TTCGCTACTG 540
CGTTTGTTTT CGAACCTAGA ACTATCGTCC TGGAGGTGAA TTCAACCAAT CCTTTACATC 600
CATAATCGCG CTCCTATTGG GTAATGTGAA CTGTTGCAGG GATCTCGGCG TTATTCGTTT 660
GGCTAGCCAA GTGATACGGC GTAGAGATTG ACCTATGAGC GTGCAGATGT AGAAAATTCC 720
ACGCATTTAA ACCAATCAGC GGCCGAGTAA ATGCCATACT TCCCGCCTCA TCTCTCTAAC 780
CGTGTCCTGT TGACCTCCTA AAATTAAGCA ATCCAATATC ATGTTGTATG TTAGATAAAA 840
ATGCATTCTT GATGAGATTA AGGTTTGCTT GTTCTTCTGC TCAGTTCGTA TGATTAAATA 900
TTACCCTCAG TGTTGCTTTG TGCTGTTTAA ATGTAATATT TAATGTAATG TTTCGGTGCT 960
GCATGTTGCT TCGAATGTGT GGTTTTGCAT TATGAATGTT CTTATACAAC GCCAAACATG 1020
AAAAGGGGAA ACAACGCGGA AAATGAAAAA GAAAGAAGTG ATTTCCAAAT TTCCTTTGAC 1080
TTGTAATTCA TTGCAGACAA TATGAACACA AAATATTCCA TGTTTTGTCT GGTCAACTTC 1140
AGTTGATTTG TACATGAAGA AAACGAAAAG GGAAAAAAGA AGAAAGGATC ATCCAGACTG 1200
ATACCAGCAA CAAGTTCAAA AGCCAGGCTC TGTCATGGGA CGGGGTTGTG TCAGTGCCAT 1260
TGGCAAAGGT AACTTGCGCT TCTGTGAGGG CACCATTAAT GCTAAAAAGT ACATTATGCT 1320
GCCTCCTTTT TAGGACAATG CAAAACCACA TTCTGCACTC ATTACAAAGT CCTGGCTGTG 1380
GAGGAGGAGG ACAAAGACCC TGTACTTTTT GTACTTTGTT TGCAGGAAGA ATGGGACAAA 1440
TTTACACCTG AAACACTTTA TCACTTTTGT TGTCTTCAGT CCCTAGACAT CTTTTAAATG 1500
TTGTGAAAAG GAATGGCAAC ATTACAAAGA GCTAAATGCA TTTCTGTTCC AACTTTTTTG 1560
AAATGTGTTG CAAAAACCAA AACTGGAAGA ATTATTTAAA AAAATAAATA AATAAATAAA 1620
TCATGAGGAA CACCTTAAAT AATGTGCTTC TGTGTTGTCT GCAATGAAAT ACAAGTCAAA 1680
GTAAATTTAA AAATCA 1696