EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32919 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:29556684-29557792 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:29557462-29557483CTTAGGTTTCGGTTTCTTTTC+6.45
IRF3MA1418.1chr3:29557465-29557486AGGTTTCGGTTTCTTTTCTCC-7.33
IRF4MA1419.1chr3:29557465-29557480AGGTTTCGGTTTCTT-6.37
IRF8MA0652.1chr3:29557466-29557480GGTTTCGGTTTCTT-6.09
IRF9MA0653.1chr3:29557466-29557481GGTTTCGGTTTCTTT-7.33
Enhancer Sequence
TGACGTCACC TCCTTCATAG AGGTAAGCGT GTTTTTCTAC TCCTTTAAAA CGCTGAGTTT 60
GACAGAAAAG TGTGGCGTAC ATTTTGCTCA TAATCGACTA CAACGGTAAA TAATTGAATT 120
TGGATTCTTT ACTTGCTGAT TAACAAACTT ATTGAACGCA GAGGTCGGAA TGTGCGAATA 180
TAAAACCAAC TTTACTTCTA TCTAGTTTTT CTGCTTTCTG TGTTGCTGTT GTTGTTGTTT 240
TGTTATATAA CTTATCTCAT CTGATGGACA AAAGTTAAGC TCCTTCATCT GGTTATAAAC 300
GAACTCAAGG ATTTCACTCT GAAATGACTT ATCTAAGTTA AGGGATTGTT CACTCAAAAT 360
GTACATTTCC ACACAATTTA CTCATAAACA ATCAACCTTT AAGAATTTAT TTCTTCTGTT 420
CAACACATTA AAAGAGAATC TGAAGAATGT TGGAAAAAAA CAGCTATTGA CATCCATATT 480
AACCAAAAAT ACAGTTAAAG TTAATGGCTG AATTTACCCA ACAACAATGT CATATTATCT 540
TCGTGTTTGT TTAACAGGAA AACAAACTCA AAAATTTAGC CCAATTGTTG ACAGATAAAT 600
TACATTTAAG TAACTTTAAC ATATGGCAGC AAACAAACAA CTTCGATCTA AAATATTACT 660
TATATAAAAT AACAGGCTAC TCACCTGCTG TCCATCGTAC AGCCTGCTAT GCCGATGTAA 720
ACCTGCTAGA CTGAGTAAAG AAAACTACAG GTAAATCTTT TGTTTATAAT GGAGGAGACT 780
TAGGTTTCGG TTTCTTTTCT CCATTTCAGT TGCTCCGCCT GTAACCAAGA ATTCTGCGTC 840
AATCAAATCC CAACTTGCTT CTCTCACGAA AAATAGTTCC ACGTTGAATG TTATCAGTCG 900
CCATCAGCCA AAGACAATAT AAAGGCGCAT TGTATGGCTG TGCTGCTGAT GACTCCGTCA 960
GACATTCCTG TGCTCACATG GCTTTTAGCG TCATGCGTTT GTTCAGTCCA TAAGAGGGCG 1020
TTGAACCTCA TGCAGTTAGG GATGTCCTGG TTTTGGGAAA TATGTTTTCA GATTTTTTTT 1080
AAAAAAATTC ATTCTCGTGA AAAGTGTG 1108