EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32852 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:27671048-27672726 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr3:27672304-27672315GGTCATAAAAC+6.02
CDX4MA1473.1chr3:27672304-27672315GGTCATAAAAC+6.02
CEBPAMA0102.3chr3:27671674-27671685TGTTGTGCAAT-6.14
EOMESMA0800.1chr3:27672335-27672348GTTTTCACACCTC-6.78
FOXA1MA0148.4chr3:27671309-27671325GCTTAAGTAAACAGTG+6.19
GATA2MA0036.3chr3:27671660-27671671TTCTTATCTGT+6.14
GATA6MA1104.1chr3:27671659-27671672TTTCTTATCTGTT-7.34
Gata1MA0035.3chr3:27671660-27671671TTCTTATCTGT+6.62
POU2F1MA0785.1chr3:27671474-27671486ATTATGCTAATT+6.44
POU3F3MA0788.1chr3:27671474-27671487ATTATGCTAATTG+6.36
SREBF2MA0596.1chr3:27671096-27671106ATGGGGTGAT+6.02
TBR1MA0802.1chr3:27672337-27672347TTTCACACCT-6.02
TBX2MA0688.1chr3:27672337-27672348TTTCACACCTC-6.14
Enhancer Sequence
TAATTGTTGT CATTTGTGTT CTCTGACTTT CGTACAGTTT ATAACAACAT GGGGTGATTT 60
AATGATTTCA AAATCCTTTA GGAATAAATT AACACTTCAA AGTCAGATCC CAAAATATTA 120
CCTAGGACTG CAGGTTTCTG AATAAAATGA GAATCACGAT TTTTGCTTTT TGCTTAGAAT 180
ATACACCACG GTTCTCTCAT GAGTCTGTAG AATCTTCTTT TAAAGATTTA CCTCTGAGCA 240
TTAGCCATAA TACAATCTTG AGCTTAAGTA AACAGTGTTC GCAAACTTTA TGTTGTCAAT 300
AGACTGCATG TTTTAAAGTA GTTAAAGACA GTAGACGGCT ATCTGATGAT CTGTTTGCAC 360
AGACTTGAGC CATCGTTGCC ATACAAACTC GAGACAAGCT CATAGTCAAA GATAATGAAA 420
TGGCAAATTA TGCTAATTGT TTCTCCAGAA AGCTCTATGA AGTTTTGATC TGTCCGAGAA 480
GCTCATTGAG ATGTAAATTA GAGTTCAAAG CCTCTTCATA GACTAGATTT GGCCTTTTCG 540
CCTCTACAAG CCATATCAAT GTCTTATAAA GATCATATTT TGTAAGCTCC TCCATTTGTG 600
TGACCTGTGC CTTTCTTATC TGTTCATGTT GTGCAATCCT ACCCTCAGGC GGAGTTCACC 660
AGCCTGGCTA CTTTTTGTTT GTTGCTACTG TATGTAAGAC TGGGAGATAC ACAAAAAAAG 720
GAACAAAACA GCACCTTCCA GTCTGTCGTC ATCATGCATG CATGGAATGC CAAACATGCA 780
TACTTCACCT GACATTTTTG GCCATTGTGT CTGCATTGCA TTGCACTTTG TTTTGACGTA 840
TTGATTTCTG AGATACAGAA AACATGTCGT TATGTCGCAG AATTAGGCAA ATAGTGGACC 900
AATAAATCAA ACATGGTACT ATTAGATTAG ATTTAACTTT ATTGTCATTG TGTTAAAATA 960
CTGTACAATG AAATGGACTT AGCTTCTTAC CAGAAGTGCA AATAACGAGT ATTAATATTA 1020
TAAATGTATA CAGCTATAGT ATATGGGATT TAGTGCAAGG TTGTAGAGGT GAAGCTGTAT 1080
TGTGTGCTAG TGTCTAAATA GTAAACAGCA AAAAGTCTTG CAAGACTGCA TGTATTGTAT 1140
GAAGTGTTAA TGAATGGTGC TGTTTTGGTT AGTACACACA CTTGCTGAAG CATGCACATT 1200
GATATTGATT GTAGTGTTTA TTGCATCTGT TGACTCATTT TGTGAGGACA TTAAATGGTC 1260
ATAAAACCCC CACTGTCTCA GCATGGTGTT TTCACACCTC TAGTTTAAAA AAAGTCAGGA 1320
AAGTGGGCGA GTCCAACTTT AGGTGGGAGT GTCGAGTGGC AAAAGAGGGT TCTGCATAAA 1380
AAAGGGGAGT TTCATTACTT GCACAATAGC AGATTTTCAC ACCAGCAGTA CAGACACAGG 1440
GGAGATAGAC AGAGGTTCGG AGAGTAGTAC TTACAGTGGG TCTGAGAGCT GTGTGGAAGT 1500
AGAGGACTTT CAGTCCATAA TATTATAGTG ATATTACTGT AAACTTGGTA ACTAAATCAT 1560
TTTGACTAAG GTATGTCTTT AAAAACTGAA AGAGTACTGC TGACAATACT AACTAGCATT 1620
GCCATCTGAA ATAAGCATAA ACGAACATTA ATCGCACAAT TACCAAATCT GTAGAGAC 1678