EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32821 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:26677919-26678975 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr3:26678073-26678083GTCACGTGAT-6.02
IRF1MA0050.2chr3:26678864-26678885ACTAGCTTTCGCTTTCGTTTT+7
IRF2MA0051.1chr3:26678863-26678881CACTAGCTTTCGCTTTCG-6.26
IRF2MA0051.1chr3:26678869-26678887CTTTCGCTTTCGTTTTCC-6.88
IRF3MA1418.1chr3:26678867-26678888AGCTTTCGCTTTCGTTTTCCT-7.01
IRF7MA0772.1chr3:26678868-26678882GCTTTCGCTTTCGT-6.74
IRF8MA0652.1chr3:26678868-26678882GCTTTCGCTTTCGT-6.14
IRF9MA0653.1chr3:26678868-26678883GCTTTCGCTTTCGTT-6.77
SREBF2(var.2)MA0828.1chr3:26678073-26678083GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr3:26678073-26678083GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr3:26678073-26678083GTCACGTGAT-6.02
Enhancer Sequence
ATGCAGACAC CAGATACGCT ACTATAAGCT TAAACAAAGC CTATTCAATC AAAATGTCTG 60
GCTCAACATT ATGCAACAGT CACCTCTGCC CTGTTTACAA TGAACAGTGC TTACAGAAAA 120
GGTGGCGTTT TCATGTAAAG ATACTGCTGG GCGAGTCACG TGATAAGGAA AGCCAACGAG 180
AAAGCTAGGG ATTTTTTTGT GCGTGTGTCT GATGAATGAT CCACACCTTT TATAATAATT 240
CAACGACTTT GCACGGAACA CGTTTGTTTT TGTTGTTATT ATTTGGTCGA GAGACGGTTT 300
CGTTTAATCT AGGTCACAAA AAAACTCTTA CTACATAACG TATATTTATG TTTAATGGGA 360
TTTGGCTGCA GCTCTGCACA GTATTGCTCC AGCCCTAATC AAGCACAGCT GATCCAACTA 420
ATCACGGTGT TCAAGACCAC TAGAGACTAT TATTAGGGTT GGAGCAAAAC TATGCAGAGC 480
TGTGGCCCTC TAGGAATTGA GTTTGAGACT TATGATCAAT AGAAGGAATG AGGAAATAAT 540
TGTGTACTAA ATACTGCACA AACTTAAGGG AAGTGTTTAA TGAGGCCATG ATAAGAATTG 600
TTTCATATAA ATAAACAAGG GTAGATGGAT TTCTAAACAC TGGCTGCTAT TCAAGGAAAC 660
CACTCGAGTC TTTTTCTATT TGTGGCTTGT GGGGTTTAGT TCACGTGACC TCGAACTGAA 720
AGTGACCGGT CAGAATTACT TTAATGATAA GTGACAGGAT GATAAATGTG AGACTAAATG 780
TATAGTTAAG TATATCTTTG CAGGCTTGCA GCAAATAATA TAATACATTT AAATAGGCTA 840
CTCCCCATTT TTCAGAAAAA CGCATGAAAA CGTAAGGTAA TTTAGAGAAA AAAACATTAG 900
AGAATTACAA CGCCATCTCC AGGTAGCTTT GTATTAAAGC AGTTCACTAG CTTTCGCTTT 960
CGTTTTCCTG TAAAGCAGTG GGATACGCAG AAAGAAACAG ACTGAATTGT TTGTATATGC 1020
AAACATATTG CTATTGTACC ATAAAGGAAC AAGGTA 1056