EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32793 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:26311071-26312411 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr3:26311999-26312013TGATGATGTCATGG-6.13
IRF3MA1418.1chr3:26312136-26312157CGAGAGAGAAAACCGAAACTG+6.24
JUNMA0488.1chr3:26311998-26312011GTGATGATGTCAT+6.87
JUND(var.2)MA0492.1chr3:26311997-26312012GGTGATGATGTCATG+6.32
Enhancer Sequence
AATGTGTGAG TAAACAATTA CTTTACCTGG TTGAACAATC CCTCTAAACT AAGCAGTGAT 60
TTCCCCCCTA ACATTTACAG CAAGCAAAAA GATGTGAGTA AAAGAGACAG CGGAAAGAAA 120
TGTAATAAAG TGATTTGGAA AAGCATGTCC AGGAAGCTCT TTTCTGCGCT TTAGGCCTCT 180
ATAGGGTGAG GGGTGAGAAA TCTGTGGATA AAACTGAACT GCCATGACAC ATTTCAAGCT 240
TCCCTTCCTC TCCCATTGTC CTTTTCCTTC AGAGCTGTCT GTGAGAAAGG AGGTATTGTC 300
ACAGAATAAT TACTCAATAA TACCCACTAT GGCTATGCCT TCAGTGATAA TGAGCCACTA 360
AACGCTCACA GGCCCTTCCC CCAGTCCAGG CCTGAATGAG TTAACCACAC ACTCACTGAA 420
TGGACTCCAT TATATAGAGG AGTTGCGGCT GCAAACATTT AGCAGTGTTC AAAATGAGGT 480
GATGATGCTG CTGGGCTTCT AGCCCTCATT CAGAACAGAA CGCCAAAATC ATGTTAAAAG 540
TGGGCATGGG ACGATAACCG GTTTCAAGGT TTACAGCGGT TTCGAAAAGT CAAGGTTTTA 600
AAACCGCTAA AATTTGAAGT GGTGAAGACA GCAGAAGTCA ATGACTTATT TGAATTATTA 660
AGCTTGACAT GTTTACTGTA CCAAAATATT ATAAATGTTT CCAAAAATAT AATATATTGT 720
GTTCAATGGA GTAACAAAGT CACAATACTG TGATACTGTG GTATTTTTAT CCAAGGTTAT 780
CATGCCATCT GAAACTTATA CCGGCCCATG CCTAGTTAAA ATAAATCAAA ACACTTTACT 840
TAGAACATCA TTATGGTTAA ACAAAAAATA AGTGGCTTCA TCAACTGGGT GGTTACTGGA 900
AAAAAAATCA GCCCGATGTG GCACACGGTG ATGATGTCAT GGTTTGGCAC ACAGGCGCAC 960
AGTAGGGAGT TTATGAGCAA ATGGTTTGCC GAATACACCG CTGCATCTTT TAATGTGAAA 1020
CCACACCACG AGCAACATGG CATGAAGGGG AAAAAAAAGC GAGAGCGAGA GAGAAAACCG 1080
AAACTGAGAA AATGCGAAGT TGCAGTTCTG TTGAAGGAGC TCGGAAAAAA TAAAACACAG 1140
CCAGCTGTGT GAAAACTACC AGGCTGGGAA TGACAAGTTT GAAACTCATT TGGACTGGGC 1200
CTGTGGCTCT GTCTACAATA GAGGGAGAGT GAGTCACTGG GGTCGGGCAT GACCACGTTA 1260
GGATTGACTC TGTACTGGAG GCTAATGAGA GACTTCCAGA CCAAAGGTGG GGAGGGAGAG 1320
AAGGGAATTG GCTGCTGCGG 1340