EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32776 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:25841631-25843199 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Atoh1MA0461.2chr3:25841703-25841713AACATATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr3:25841703-25841713AACATATGTT-6.02
BHLHE23MA0817.1chr3:25841702-25841714AAACATATGTTG+6.52
Foxj3MA0851.1chr3:25841898-25841915AGAACATAAACAAAGTC+6.03
Foxj3MA0851.1chr3:25841831-25841848AAAAAGTAAATAAACTA+6.15
OLIG1MA0826.1chr3:25841703-25841713AACATATGTT+6.02
OLIG1MA0826.1chr3:25841703-25841713AACATATGTT-6.02
SMAD3MA0795.1chr3:25842416-25842426TGTCTAGACG-6.02
ZNF24MA1124.1chr3:25841777-25841790GAATGAATGTATG-6.37
Enhancer Sequence
AGGATTGGCA TAGGATGTCA TATGGATGTT TCCCAGTGAT GGGTTGCAGC TGTAAGGGCA 60
TCCGCTGTGT AAAACATATG TTGGATAAGT TGGTGGTTCA TTCCGCTGTG GCGACCCCTG 120
ATGAATAATG AGACTAAGCT GAAGAAGAAT GAATGTATGT ATGTATGAAT GAATATCTTC 180
AGGGTGGCTA CTAGCAAAAA AAAAAGTAAA TAAACTAAAT AACCTGTAAA TCTCTGAAGT 240
AAAATACAGG AAATTTGCCT TCCTTACAGA ACATAAACAA AGTCACAAGT AATCAATATT 300
GAAATGTAGG CCATTCCTAC GAGCTCGAAC TCTCAAAGTT GCAAGCATAC GTAAACATTT 360
TTAATTTTTT TCCAATTATT TAAATAAAAT CTTGTTGCAT GAATAGTATA TTAATGGTAA 420
TACTGCTTGC CATTGATAAG CGCACACGCC GCCCGAGAAG CAACGTCAGT GCCTTCCGTG 480
TAGTAACCAC GCCCATGTGC CTCTGTAACG TTAACCCTCG CATTTGGTCG GGACTTTTCC 540
TGGCGGGCGT TTTTTTCATA CACTGCAAAC CCAAATCTGC CAACCCTTTT TTTTTCACAA 600
AACTAAATCA CTTTTTTCCT TTTAATTCTA ATGATTCCCC AGCGTGTTTC TTATATTTAC 660
TGACGTTAAC ATTTTCGCAC AAATTTCCGC TTGCTATGTG CCTTTCACTA TGCATGGTAC 720
GACAAATAAT AAAACAAAGT CTGCAAAACA CTGGTCAGTT TAACATCAGC GTTTGGTAAG 780
ACACTTGTCT AGACGTCTAA GTTAGTTATT ACGTTATAAG CGGACACGTC GATATGAACT 840
TGTGACTTTT AAGACTTGTG TATCTTTTGT ACAGACACAA AATAGTTCAT ATTTCAATAA 900
GTCATCATGA CCAGGTCATG ACAAACGAAA CCACCTCACA TGAAAGCACT TTAAAGCCTC 960
TTTACATTTA CTGTTAAAAC GGGATACAAG GTTTAGGAGT GTTAACGTTT CTGTCTGAAG 1020
AGGGATTGTA CGCACTCATT CACAAACAAT TTAGCCCAAA TCACGTCTTT GGACTTGCAC 1080
CAGGAAACCC ACGCGAACAC GGGGATCACT GCAGTACGTG CAAACTCCAC AAAGAAATGC 1140
CAACTGACCC AGCCGAGCCG AGGCTCTCAC CTGCGACGTT CTTGCTGTGA GGCAATTGTG 1200
CCACCACCAC CGGGACGGGA CGCCCCCAAT ACTCGATATT TACATGATTA TATTTTACTT 1260
GGAATTTATA CATAAAATGT ATACATCTCC AAAAAGCGGG CAAATATAAA GCTGATAAAT 1320
TTGCTTAACG TTACGTTACC TGTTGAAATA TTCTCTTCAC GTTTTGAAAA GGAGGATATA 1380
GACGGACTTA TTTGGCTTGT TTTTCTTCTT CTTTAGCTCA CGTCTTCGAA AAAGCGAATA 1440
GCTGAACGCG GAGGAAATGG TTACCTGTCT ATCCATTATG CGGAACAGAC CTGCGTTATT 1500
ACACTAATAT CAATCCTTAT GCGTAACGTT ATAGCAGCAG CACTCTCCAG AGCAGAAATA 1560
TTCCCGCG 1568