EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32704 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:24003793-24004841 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr3:24004081-24004092TATGTAAACAT+6.14
FOXC1MA0032.2chr3:24004081-24004092TATGTAAACAT+6.32
POU2F2MA0507.1chr3:24004827-24004840TTAATTTGCATTT+6.25
POU4F1MA0790.1chr3:24004410-24004424CTGAATATTTAATG+6.39
POU4F2MA0683.1chr3:24004410-24004426CTGAATATTTAATGTG+6.64
POU4F3MA0791.1chr3:24004410-24004426CTGAATATTTAATGTG+6.29
SOX15MA1152.1chr3:24003987-24003997AAAACAATAG-6.02
Sox3MA0514.1chr3:24004240-24004250AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
TTTTACTCGT TTTGAAGTGT TTGGAGACGC ACTCGTGATG TTGACACGCC AGAGTGTCTT 60
TAACTTTAAT CGAAATGCCA CGAGCGTGAA AGTCATCAGG CTGTCACGGA TCTGCGCGTG 120
GCCATGACCG GCATGATAAA GAACCGGACG CTATTTCGGC GAGGAAAACG GCTAATGGGC 180
GAAAGATGAG GAGAAAAACA ATAGCGAAGC GCATACTGTA CAATGGATAC GAGAGATACG 240
AAGAGACAGC CGAGGAAACG GGCGCTAGGG CGAACCACGT CTTCAGTGTA TGTAAACATC 300
AAGCTTTTGT CGCGTAGTGT CATTGTTTTG CAGAGCCTTG ATTTAATTAT GTGACTGATC 360
TTTCAGCAAG AACCGGCGAA GAGGAGAAAA TGGAGAGGAC TAAATGGAGA GGACATCTCA 420
CCTTGCAATG TTGACTACAT CAAGTTCAAA ACAAAGGTCT GTTCGTGTTT TTATTGCTCA 480
GTCAATATGA CAGCAGTTCT GTTTTTAACT GATAGCTGAA TAAATTAGAT TGGCTGGCAA 540
CATCAATTCT TCTCATTTAT TAGCTTTGAG ATTGTAATAA TGTTGTGTAA TACGTTACGT 600
GAGATACAAA CGATGCACTG AATATTTAAT GTGATATATG TGCTTTAAAT CGTTTCAGAT 660
TTGTTTATAT CTGTAGTTTA ATGAAGGTTA ATAGGATCAT CAAATGAAGA CACTAGAGGC 720
ATCGTTTGGG GTTCCTCGCC CTGGCAAAAC CCTCTGGAGG TCCATTAGGT AACATTTCAA 780
AAAGGAAAAA GCTTTCTAAG AGTTTAAAGG AAACCCCATT GTACTTAATA GGCTTTCACC 840
AGTTTCTCAA CAAATCCTGT TATTTGGGAA ATGTTTAGAG GTGCTTGAAT TTTTAACAAG 900
AAGCTTGAGA CATTTGGATT TGTCAGCGTG AGGAATGCTG ATTGATGCCT ATCAGTTTCT 960
TGAAAAAAAA ATAGCCAAAA CTGTGGTATT TTAAGTGAAA CAGTCCATTG TATTCATGTT 1020
TAATTCATAT GGTTTTAATT TGCATTTA 1048