EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32682 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:23796131-23797380 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr3:23797072-23797087CCGACCTTTGAACTG-6.13
Lhx3MA0135.1chr3:23796230-23796243AAATTAATTTATT+6
MEF2AMA0052.3chr3:23796792-23796804GCTATTTTTAGT-6.18
MEF2BMA0660.1chr3:23796792-23796804GCTATTTTTAGT-6.62
MEF2DMA0773.1chr3:23796792-23796804GCTATTTTTAGT-6.37
RARA(var.2)MA0730.1chr3:23796667-23796684AGGTCAAACGGCGGTCA+6.01
RXRGMA0856.1chr3:23797073-23797087CGACCTTTGAACTG-6.09
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:23796667-23796684AGGTCAAACGGCGGTCA+6.25
ZNF24MA1124.1chr3:23796907-23796920GAATGAATGAACA-6.3
Enhancer Sequence
TTGAATCAAA TAAAAAGTCA CAATTCTGAG GTCAAAATGT TGCTAATAAA TCTGCAAGTA 60
AAGTAAGACG GTACAGCTGA GAAAGATAAA TGATTAGCTA AATTAATTTA TTTCATATAA 120
ACCCGTGTAG GAACTCTACG TAAACTTGCA CTACAAAAGG AAAACCTGCA ACTTGACATG 180
CTTTTACAAG TCTATACTTC ATGTATTTCT GATCGTTGAA AGGTTTGAAA CTCAGCCAAC 240
AACTCTAATC TCTCTCTTTT ATTTATCAAG ACACAAAGAG CTGTGTGTTT GTTTACGGCT 300
ATGTGTGTCA AAACTCCTGT AACATTCCAA GCGAGGTCAC GGCTGGGTTA AGGAGGGGTC 360
AGAGGTTCTC CGTGAGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TTCAGCAGAA 420
GAATGTCAGA GGCCCACTGG CCATCAGTCT GCTGGGGAAG GAGGGACAGA CTGGAGGGGA 480
GCGGAGGTGA AGGATGGGAG TTTGGGGTGA AGGGGAGGTG AGGGGGCACT CAGGGAAGGT 540
CAAACGGCGG TCAAATACAA AACACACTCA CAGTCGAACC AGTCGGTCCA GCTCGCCCTA 600
CATTCCAACT TACCAGATGA CCATTTCCTT TTCACTCACA CACTCACACA CAGAGCTAGA 660
GGCTATTTTT AGTGTTCTTA CAGAAAGAAA ACTAGGGAAT GTGGGTGGCA AATCCCACGG 720
TGCCCTTCAG CCCCCCTCTG CCTCGCCCTG TACAATGGCA GAGCCTGAAT CCCCATGAAT 780
GAATGAACAC AACATGCAAC CCGCATCCTA AACTGGTATC AATGCACAAA GCGTGGTCTT 840
CTCTTCCAGA CTGGCACATA GCAGAAGACC CCCACTGTCC TTAACACCCC CAGCCACACA 900
TAATCTGACC CCCGTCCAGC CCTGATGGCT AAAAAATGAG ACCGACCTTT GAACTGAAGT 960
CGCTCTCTCT CTCTGTGGGC GCAGATGACA GACCACAAAT CAGACTCGTC GTGCAAAGCA 1020
TGTGGAGATT TCACTTCATA GAGCTGTGTT AATCTGCTTT AAGTGTACCT GAATAACACC 1080
TCAATTATTA ATTAGTTAAC ACAGTTAATA ATGTCTTGTA GAATCTACAG TAACTCTCTA 1140
GCAGCAGTTC ACCAGTAACT TACTGTAAAT TGTTTACAGC TAAAATACTG CATTTATGTT 1200
TAAAATACTT TTTATCTTGA TGTATAACAG TTGACGTCAT AATTATTAG 1249