EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32653 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:23514392-23515329 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr3:23515123-23515140ATTAATTAATTAATGTT+6.13
DMRTC2MA1479.1chr3:23515288-23515300AATGTAGCAAAT-6.18
FOXP2MA0593.1chr3:23514597-23514608AAGTAAACAAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr3:23514594-23514611ATCAAGTAAACAAAACA+6.12
Lhx3MA0135.1chr3:23515125-23515138TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr3:23515122-23515135AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr3:23515121-23515134AAATTAATTAATT+6.92
Nkx3-2MA0122.3chr3:23515270-23515283ACAACCACTTAAC+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:23515123-23515133ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:23515127-23515137ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:23515123-23515133ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:23515127-23515137ATTAATTAAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr3:23515187-23515199TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:23515188-23515200TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
TAGCCCGATA TCAAGTTGAT GGCTGTATTG TTATACACCA CTGCTTTGAT CGCTTGCAGG 60
TTAAGGGAGA GGCTCCACCG AGGCTGTAGC TTGCAGTGGC GCATATATTG AGAAGGGGTG 120
ACAGACGTTT TCATGAACAG ACAAGACATA TATACTGTGT CTTTATTTAA AACGTTCTGA 180
TACTCAGTTT ATCAGTAAAT GAATCAAGTA AACAAAACAT AATATTGTAT GTATCTATTG 240
AGTAAATAAA TCTGATTATC GTCAACACGT TGACCAAGAA ACACAGTTTG GTATGTTTAC 300
AGTATGTTTG AGATTCCCAA GAAATCACAT TCTTTAATGG CATTGATGGT CCCATGAAGA 360
ACTTTTTAAC ATCCGTGGAA TCTTTCCAAT GAAGAAAAAG TTCTCCACTT GTGGAAAAGG 420
TTCCTTATTA CAAAGTTCTT TCTATCAAAA AAGTAACGAG CGAAGGAAAA GGTTATCTTT 480
TAATGAATGT TTGGCTAAAA TATTTTTTGG AGAACGGTTC CAGAATTTTG GAAGAACTGT 540
TTTGTGACTG CACATTTCAA CAGATACATT AAAAAATTTT AAAAACTTTT TTCTATATGC 600
ATATAATTAT TCACTTTATT GGTTGCTTTG TGCTTCATAT ACGTTTTTTA AACATTTTAG 660
TTTACATTAA ACGTTGGCGG TTCATTCTGC TGTGGCGACC TCTGATAAAT CAGGGAATAA 720
GCCGAAGGAA AATTAATTAA TTAATGTTTA GTTGGTGATT TATTTATGAT ATTGTGCTGA 780
TCGTTCACTG AATTATTTTT TTTTTTTTGT ATTTATATGG GTTGAATTTA AACTGTAACT 840
CAATTTGTTT GTTTAAATTA AGCCCAAATG GGTTGTTTAC AACCACTTAA CGTAAAAATG 900
TAGCAAATGC AAGGAATCAT ATTTGAATTG TTTTTGA 937