EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32633 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:23347550-23348989 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CENPBMA0637.1chr3:23347692-23347707CCCGCTTTCCACGAA+6.52
FOXA1MA0148.4chr3:23348661-23348677TTTTGTTTACTTAAAC-6.56
FOXC2MA0846.1chr3:23348662-23348674TTTGTTTACTTA-7.22
FOXP2MA0593.1chr3:23348662-23348673TTTGTTTACTT-6.62
RESTMA0138.2chr3:23347849-23347870GGCGCTGTCCTGAGTGCGGGA-6.42
Enhancer Sequence
AAGTTGCAAC ACTCCCCGGT GTCCCTAACT AAAACGTGTC TGTCTGAACG AGTCCACGTT 60
TAAATAGAGC AACAACCCAA TTACAGTGCT TTTGTTTCCC TCAGACCGCT GGGGTGTTTA 120
CATTAGAGGA TGACCGAGAC TACCCGCTTT CCACGAAAAT AGAGCGCCGG GTCGACGCCC 180
ACTTTAGTGC TCCACTTCAG AGCTGAAGTC GTAACAGCAC GTGGACGAGC CTGGTGACCG 240
CGCGCATCCG CAGCAGTACA TTCTGCGATG ACACACCCCT ATCACGCTCC TGTGCGTGCG 300
GCGCTGTCCT GAGTGCGGGA ACACTCACAT GGCGCACGGG GACCCAGCGA CTGCAGAGAA 360
CAGCACAACA AGGAAGCATG ACTCTCGGTG CCGCATCCAC AGCTTTCCGA CATCGTTTAT 420
TAGGCGATTA TATTTGCTTT GAAGACTGAA CGGTTCCGCG AGAGCATTCC CATCGCAAAG 480
CTTAGACGCT TGAATTAAGC AGCATGCATC ACAGAAGACT ATCACAATGC GTTTTTTAAG 540
AGATTAAATG TGTTTATATT GCTAAATCAA CGAGGTGCGT TGATTACAGA ACTCAGCCCT 600
ATAATGATCC TCGTGAGAAA AGGATTAACT CGACCACCAG ATCGCCCGAA GTGAACTGAT 660
TATTTAAGAA AATGTGATTA AAGCAGCGGC AGCGAGAATG AAAGAAGGAG CGCCCCGTTG 720
CTTATTGAGT CACGCGGACA GTAGGTTAGC AGGCGGCTCA AGTGACCTAG ATTCATAATG 780
TTGAGGAAGT TTAGTCTTCA CATTTGAAAA CTTTTTTTAT TTCAATTACA TGGCCTTTTC 840
TCGATTTCTA CTGCTTGTTT GCCGTGGATG TCCATTTTTT AGATTCACAT GAATCGTTCA 900
GGGCGTGATC TGGGATTCAT CTCCAATTAT TACTAGTTTT TTTAAAATAT ATAATATTTT 960
TATTATTTCA GATCTTGCAT ATAATACTGA CACTATGCCT GTTATACTTT GCTATATTGC 1020
CGAGTCCTAT AGGAGCACTC AAGCAGCCCC ATGGTCACCA CTTCTCATGA ACCCTATCGC 1080
TATCGAGCGT CTGTTTGAAA ACACTCACTC TTTTTGTTTA CTTAAACGTT GAAACGTTAA 1140
TAAATCCCGG TAAAAAAGAC TAATATTAGC TCTGAATGAA TAATTCGTGT AGCTAGCATG 1200
TTAGCAAAGA CCAGCCTGCT ATAACGTCGG AGTAAAATCA GAATAATGAT GTGCCTCAAT 1260
GTTTTACCAA GACCTTTCGA TGGTCTTGGC TGTCCTGTCG CCTTTGGTGT TACCAGATGG 1320
AGAAAACCCG CAATGATGAG AGGCTAATGA GTGCTCGCCA TGCAAAGACT TCCTCACGTT 1380
GTCGAGCACG GGCGCTGTTG CGCCAGACAA CACAGAGGAC AAATAACACA GGCATAGAT 1439