EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32378 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:15981892-15983970 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:15983009-15983020ATATTAATTAT+6.02
FOXA1MA0148.4chr3:15982943-15982959GCATATGTAAACAAAC+6.32
FOXC2MA0846.1chr3:15982946-15982958TATGTAAACAAA+6.74
FOXK2MA1103.1chr3:15982947-15982958ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr3:15982947-15982958ATGTAAACAAA+6.14
Foxj3MA0851.1chr3:15982944-15982961CATATGTAAACAAACGA+6.15
Gata4MA0482.1chr3:15983221-15983232AGGAGATAAGA-6.14
RFX2MA0600.2chr3:15982918-15982934CGTTGCTATAGCAATG+6.04
RFX2MA0600.2chr3:15982918-15982934CGTTGCTATAGCAATG-6
RFX3MA0798.1chr3:15982918-15982934CGTTGCTATAGCAATG-6.11
RFX5MA0510.2chr3:15982918-15982934CGTTGCTATAGCAATG-6.34
RFX5MA0510.2chr3:15982918-15982934CGTTGCTATAGCAATG+6.3
Enhancer Sequence
TTATATCTCA CCTTTGTGAT GTGTAAAACC TAAGTTATTC AGAGAGCTAG AATGAAATAA 60
CATCAAGTGC ATGTGCACTG TAAAGCCCAA TAATTTCAGA TAACTCAAAT CATTTGAGTA 120
AACCGATTGC AACAAACCAT TTAAGTTCAA AAACTAATTC TAATGAGTAC TGTGAACTTA 180
AATCTGTTCA AATCAAAATC ACTCACCGGT CACTTTATTA GGTACACCTT AATAGTACCT 240
GGTTGGACCT TTTTGCCTTC AGAACTGCCT TAATCCTTCG TGGCATAGAT TCAACAAGAT 300
ACTGATATAT TCCTCTGAGA TCCATATTGG CATGATGGCA TCCTGGTCTA CCACATCCCA 360
AAGGTGCTCT CTTGGATTGA GATCTGGTGA CTGTGGAGGT CATTTGAGTA CAGTGCACTC 420
CTTGTCATGT TCAAGAAACG AGTCTTCCAG GATTTCAGTA GATCAGCAGT TTCTGAAATA 480
CTCAGACCAG CCCATCTGGC ACCAACAACC ATGCCACGTT CAAAGTCACT TGAATCACCT 540
TTCTTCCCTA ATCTGATGCT CAGTTTGAAC TTCAGCAGAT CGTCTTGATC ATGTCTAACG 600
TTATATGCCT AAATGCGTTG AGTTGCTGCC ATGTGATTCG TTGATAAGAA ATGTGCGTTA 660
AGCAGTTGGA GAAGTGTACC TAATAAAGTG GCCGGTAAGT GTATATTCCT TTATCGATTG 720
TTTTCCCATT TACTTAGCAT CCTTTCAGTA TCGCCTTTTT TTAGCCACGT TGAAACAGAA 780
ACGGTCCCTT TCGCTGCTTC TTTCTTCAGA TTTTCTTTAA ATTTTTTCCC TCTTTCATTT 840
GAAACTAGCT TTACGTTATA ACAAAAAGAA AGCGGGTAAC TTACATTAAC ACATGCCCTC 900
TTAAGCTATG TTTAAAATCT AAGTTAAGCA ATGACGCTAA ACACACAACT CACCTTAAAT 960
GTCCGTTTTG TTTTTATCAA GGTAAAGCTT AGCTAAGATA AATAGTAGCA AAGCTACTCG 1020
ACGTCACGTT GCTATAGCAA TGGCGCCAGA GGCATATGTA AACAAACGAA TTTCGTCTCG 1080
AGTTATTGAT GTTCGTTGCT GATTTTCTCG TGTTCTTATA TTAATTATCA TAAGTTAAAT 1140
GCATTTTGTT TGTCTCCGTG TTTTGATAGC ACTTTTAACT AGTTTAAAAG GGGGAGGGGT 1200
GCTACCTTGA ACATAAAGCC TAAGTACAAA TTCAGTCAGA TGCATGTCAA AAGATCTCTT 1260
TTGGCCGTTT TCAAGTCGTT AAGAAACTGT TCAGAACAAA TGCATTAGCA CACACTGGTC 1320
TATAAAAGGA GGAGATAAGA TTATCATCTG AATGATCGAT GCAAAACGAC CTACAGCTCA 1380
GCTTCTGTTT GATCTGATAA CGATTCATTG TCCTTATCGG GCTTCGTCTG CACCTCTTTT 1440
CAACTTTTCT TAGAGCTTTT TTCTTGTTTT TAGTCCAAAT ATCTACACTA CCTGACAAAA 1500
GTCAAAAGTT TTAGGAACAA CAAATAATAA GTTGACTTCT AGTTGATCAT TTGTTATCAG 1560
AAGTGGCTTA TATGAAAGGC AAGGGCCTCT AGATTACTCT TATGTTACCA ATATAAACTA 1620
TGATCATGCC TTGATTTTTA ATTATTTTAT TAGGACTGTA AGATCTGACT TTGCTTAGAC 1680
AAAAGTCTTG TCACTTAACA GAAATGTACA GTTTAGAATA TAAAGTCATG CTGCAGTGGA 1740
AGAAGAATTA ACATTGTGTA TGATTCCCAT GAGCTTGGAG GACTGCATCC ATACATCTCT 1800
GCAATGACTC AAATTACTTG TTAATAAAGT CATCTGGAAT GGCAAAGAAA GCGTTCTTGC 1860
AGGACTCCCA GAGTTCATCA AGATTCTTTG GATTCATCTT CAACGCCTCC TTCATCTTAC 1920
CCCAGACATG CTCAATAATT TTTATGTCTG GTGACTGGGC TGGCCAATCC TGGAGCACCT 1980
AGACCATCTT TGCTTTCAGG AACTGTAATG TGGAGGCTGA AGTATGAGAA GGAGCGCTAT 2040
CCTGCTGAAG AATTTGCCCT CTGCTGTGGT TTGTAATG 2078