EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32315 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:13941791-13943083 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HAND2MA1492.1chr3:13941866-13941876TGCAGGTGTT-6.02
ZNF263MA0528.1chr3:13942639-13942660TCCTCATGCCCTCCCTCATCC-6.6
ZNF384MA1125.1chr3:13941992-13942004AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:13941993-13942005AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:13941994-13942006AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:13941995-13942007AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:13941996-13942008AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:13941997-13942009AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:13941991-13942003TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr3:13941990-13942002TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr3:13941989-13942001TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
GAGAGAACGT CATCGACAAA CATTAAACAA GAACTTTATA TAGCGACATT TACTATGATA 60
TAATTGAACA TGGTTTGCAG GTGTTTGTCA AACTGCATTC TGTAACTTCA TATTGTAATT 120
GAGTTTTTAG CACGCACTGA TTAAGAATGA AATGGGACAT TGTTTTATTT CTAAACATTG 180
CTTCAAATAT GTGCATGATT TAAAAAAAAA AAAAAAAAGT GTATTGCAAC ATATTTCATA 240
GGCACCAAGT GCTAAATGTC CTGTCAACAG TCATGAAAGA TCCCGGCCTC GCCTTAACAT 300
AGCGAGCATG CATATAGAGC AACATCCGAA TCAGTAATGA GCATGCGTAA ACACAAAAAA 360
ATTAACCATA TAAACAGATT TAACTGTAAA CATACTTAAA TAAATGCATT ACACATAATT 420
TCCCTCATCT TATTTTACAT GCGCGTAAAT AAAAAAAACA CCTTACATCA CGCCAGAAGC 480
ATGAGCATCA TCAGTAAACG CACAATATTT CAGAAAGTAG TGAGAAAATT AAACATACGT 540
ACCCTTTGTG TATTTTGTGC TCGTATCCAA ATATTTCCGC CCTGAGTCTC TTTTAGTGTC 600
TTTTTGTATT TGTGACTTAA ATGCGAAGTG ATCCGCGCAA CACTAAACGG CTTGTTCAGT 660
ACGCGTGGGT TCCGCAGCGC GCGCGTGTTT TTGCCCCGGT TCCTTGTGTT GTTCTGGCGA 720
GGCGCTCCAG TATCCTGCCG CTAGCTGCTT CTGTTTAGAA ATGTATGTTA GTAGGTCAGC 780
GGTTGCATAA CAGGACGCTT CGGGTGCCTC GTCACGTTTT GTTTCTCTCG TTTGCCCCCA 840
CCTACCGCTC CTCATGCCCT CCCTCATCCG AAAAGCCTGT GGCGGCGAGA GCGCGGAACT 900
GGGAGGGATC AGGCACCGGC CAGACCCGCT CTGTTATGGA GATACGCATA ATAGGGTTGA 960
CCTGATTCGG GGTTGTATCA TTAAGGTTAC ATGACTGTTT ATCACGTGTG GCTCGGTTAA 1020
TTATGTTACG TGTCTAATAG GTTAGTCGTG CGTAATACTC AAGTTTTCCA TTTATGAGGC 1080
ATTTAAAGAA GCATGATTTG TGTTTGTTTT AAACATGGTC AAACTAATCT AACTATGCAT 1140
TCAAAGCATA TACAGAAGCT CTCCTCCTAT TAAACTGGTG TTTTGCCAGC TGATTTTATT 1200
TAGCTTCTTA TCCCAGATAT ATTAGAATAA AGTTTTGTAG TCATATTTCA CCACAGAAAT 1260
CAAATTTTAT GTACACTCAG TAAAAATGAG TA 1292