EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32126 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:7717860-7718563 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:7718281-7718300CCGCCGCCAGAGGGCGCCC+6.36
IRF1MA0050.2chr3:7718347-7718368TTTCAGTTTCTTTTTTTCTTT+7
RREB1MA0073.1chr3:7718099-7718119CCACAACACACACACACACA+6.71
Enhancer Sequence
TGTAATTCGC AGATGACGAA AGCGCGTGCT AATAATAAAC AGGTCATTAT CCTACATTTG 60
TTTGGATGCT AATACATTAT TACAGTGATT AATCTTGGTG TTAGTGACAT TTATAGTCTT 120
CTGGATAGTT CTACTGACAT TTGGTAAGTG TTTGCTACGA AGCTTTGGGT GGTTTTATGA 180
ACAGTTTCAC AAGCTGTTCA GTGCCTAGTT TTGAATCTGA AGTATAACAA CAACACGCTC 240
CACAACACAC ACACACACAC ACACACATGA TTTGTTTACG TGAGAGAGCT TTGGGTTTTT 300
GTGACACAAA GGGTCAGATT TAATCTTGTC ATCAAAGTGT CACTCAGAGA AATAATCATT 360
AATGCCCTTC AGCTGTCTGT TTATGTGGTT ATGTCTGCAC CGGAGCTGCT GAACACCAGT 420
CCCGCCGCCA GAGGGCGCCC TGAATCAGCC AACACATACA TAAAGAGACT AAACAGAAAC 480
AGTCATATTT CAGTTTCTTT TTTTCTTTTT GGTTAAAGAA ACTATGATCC ACTTAGTTTT 540
CATTATCACT ATCACAGTTG AGCAGATGAC ACATCTGGCA AAGGTTTAAA CTTTTTCTTA 600
TTGGATTGAC CATTTTGCAA ACCGTTTCAT TTAAGCAGTC CAAACTGCAT TGTTTTAGCT 660
TTGGTAAACA TGCAGAAACC GGCTATTCAT AACTATTAGA AAC 703