EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32096 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:7219859-7220449 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR1MA0162.3chr3:7220359-7220373AGCGCGTGGGCGGG-6.03
EGR3MA0732.1chr3:7220359-7220374AGCGCGTGGGCGGGA-6.19
EGR4MA0733.1chr3:7220358-7220374TAGCGCGTGGGCGGGA-6.21
FOXC2MA0846.1chr3:7219899-7219911ATTGTTTACATT-6.32
Foxj3MA0851.1chr3:7219896-7219913CTGATTGTTTACATTTA-6.19
Lhx3MA0135.1chr3:7220301-7220314AAATTAATTAATC+7.82
Nkx3-2MA0122.3chr3:7219932-7219945ATTAAGTGTTTTA-6.16
POU6F1MA0628.1chr3:7220303-7220313ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:7220303-7220313ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CGATTCTACA TGTCATGTGT GCAGCGTGAT CATGTCTCTG ATTGTTTACA TTTATCTCTC 60
AATATTTTAA TGAATTAAGT GTTTTATATT ATTATACTAA TCCCAAATTC TGTTTTACTG 120
CAAAATAAAG CGTTTGCGTC TCTTCAAGAG TTTACACAAG CATATGTTCA GTTAAACAGT 180
CAATATTCAA TATAATCAGC ATTAAACTAC CTCTTAGTGA ATGAATTAGA TGGAGACACA 240
AATGAAAGGT GTCCAGATAA CCCGTGAGTA AGACATTACA AGAGTGTTTA CAGCGTAGCA 300
TCGAGCTAAA AACAAGAGAG TATATTAGCA TTGAGCACAC ATGTTAAAGC GGTTCACACC 360
GCAAGTCTGC GAACGCTACT ATGGTCAGAT ATCATACACT TACTCTGAAC AGACGAATAA 420
CACCTATAAC AGAAGAGGAA TTAAATTAAT TAATCCTCAA ACAGCAAAAT TCAGCTCTCT 480
CTGATCTCCG CCTCGGAATT AGCGCGTGGG CGGGATATTT GCCTGCACGC TGACCAGCGA 540
AACCTGATTG GCTGCAGTCA GGAGAAATAG TGAGTGGTTT GTTTTGGGAG 590