EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32082 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:7088477-7089853 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CLOCKMA0819.1chr3:7089359-7089369AACACGTGTT+6.02
CLOCKMA0819.1chr3:7089359-7089369AACACGTGTT-6.02
CTCFMA0139.1chr3:7088986-7089005TACTGCCATCTAGAGGACA-6.43
Enhancer Sequence
GGCGAGTTTG AACTACGAGT ACAGTAATAA AGACAAAGAA TAAATCTTTA GTAACTTAAT 60
ATAGTTTAGC TTCATTTTTT ACTTGCTTAT AAAGGAGTCA GGGTTATAAT TCAGTCAGGA 120
GAGCGTGAAA TTTGCATCTT ACTCCCTTTA TCTTGCTTTT GTGCGATACC CTCTAAAAAT 180
ATGAACTGTT AAAGAAGAAA AGTAACATAA TTAAGGACAG AATCATAAAT AAGCACAGAA 240
TCATACCTGT TTGTGTATGA AATAGCAGCT GAAATAAAGT GCAGTGTTCC TGATCGCTTC 300
TGTCGAGGAA TTTACAGTTG AGCCCCAATA TATACTGAAT AAAGGCAAGC AGCTGAAGTG 360
TCCGTCAGAT AAACAGTCTG GCAGCAGAAG GTTCAATATA AAAGCTGGAG TGTGTTGTCG 420
TGATTTCTTC AGCACTGAAC CTCCACACGA GTTTTCCTTG CTCTGAGCTT TTACTCGGAT 480
AATGCCTCTG CTAACTGTGT GCTCAGCACT ACTGCCATCT AGAGGACAAT AACAGCAGCA 540
TCCACTAATC GCCACATCCC CTTTCATTAG AGAGAAATCA TCATCTGCAG AGCACAAACA 600
ACCGATATAC AACATAAAAC TCTCTAATTG TGACTAAAAG ACAAAGTCAC CTTCACACAT 660
TTTAAATATA AGTGCCCACA TAAAAAATTG TAATAAATAC TATATAGTGT TTTACTGTAG 720
TAAAGTACAT GAATGAATCT GTTACTGATA AAAGCAGCGC TTAATTTGAG CCGGATCCTG 780
TGCCGCAATC TTTCCCAGCC GTGCTTGCTT TGTTTATGGG CGATTGTAAG TTCTCGCTGG 840
TGACGCCATC ATGTGGTTTG TATTTGAATG GCGGAAGGCG GGAACACGTG TTCGAAAATA 900
GAATCAGTGT TCCAAACCGC AGAATGTTGA TAAGAGGATG TCAAAGGTTC TGGTGAATTT 960
CCGGCTATTT CCGCAAGATT TGTGAAGTAC TTTAACCGTT GTAAATATTG ACCACAATAC 1020
TATTATGTGT TGGAGGCGAA TCGATCAGAA CTACATAATC TGAAGTGTAA ACAAACTACA 1080
AACATGGCGG ACGAGCGGGC CCAACCGTCA AAAAGTAGAG GCTTCGGTAA CATTGTGTGA 1140
ATGACTATTA ATTAACATTT AGCCGAGTGG AAAATATTTA AATTGTGTTT TCCGCGTTAT 1200
ATTTCCTCTG CAACAATAAT GTCAACTAAT ATAAAGACTT GTTTGGACAT TACCTTCTGA 1260
ATGTTATCCA AATACCTGAA GAGATTTCTC AGCATGAAAG ACTGGTGAAT GGCAGATTAA 1320
CCTGCTGTTG CTTCTCCAAT ATGGTAGGCA ACTAAATATG TAAGAAATGT GGATGA 1376