EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32067 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:6915873-6916675 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr3:6916128-6916140AAACATATGCTG+6.04
HNF4GMA0484.1chr3:6916327-6916342TGACCTTTGACCTCT-7.22
NEUROD2MA0668.1chr3:6916357-6916367ACCATATGGC-6.02
NR2C2MA0504.1chr3:6916327-6916342TGACCTTTGACCTCT-8.25
NR2F1MA0017.2chr3:6916330-6916343CCTTTGACCTCTG-6.74
Nr2f6MA0677.1chr3:6916327-6916341TGACCTTTGACCTC-8.42
RXRBMA0855.1chr3:6916327-6916341TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr3:6916327-6916341TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr3:6916327-6916341TGACCTTTGACCTC-8.12
Enhancer Sequence
CGCTGTCACC TTACAGTAAC AAGGTCACTG GTTGACGTCC TGGCTGGGTC ATTTGGCATT 60
TCTGTGTGGA GTTTGCATGT TCTGCCCGTG TTGGCGTGGG TTTCCTCCGG GTGCTCCGGT 120
TTCCCCAACA GTCCAAACAC ATGCGCTACA GAAGAATTGG GTACGCTAAA TTGGCCATAG 180
TGTATGAGTG TGTGTGAATG TGTGTATGGG TGTTTCCCAG TACTGGGTTG CAGCTGGAAA 240
TGCATCCACT GAGTAAAACA TATGCTGGAA TAGTTGGCGG TTCATTGTGC TGTAGTCTTG 300
GACTAAGCCG AAGGAAAATG AACGAATGAT ACGGTAACAT ATTGCTAAAA CTGTCTAAAA 360
TTATGAAGAC TGAATTAAGT CCACATGAAC GCACCTAAAA ATTTCCACAC TCCAGTTTCT 420
AATCTGCATG CGACACCCTG CTGCATGATG GGATTGACCT TTGACCTCTG TAACGGTGTG 480
TTGCACCATA TGGCAGCAAC AGTGCAGCGA GCGGGGGGTG TTAACTTAAT AACCAACATA 540
ATGAGTGTGT GTGTGAGTGT GTGTGTGGTA CACAGGGCAA ACCCAAGGGA CACAGGAGTA 600
AGCGTTAAGA GGACAATTAT TCTCACACAC CGAGCTAAAA GTATGTCAGA AGTCTGAAAA 660
ACACAATGGC AACTGTTATA TTTAGCACAA ATAAAGCCTG TTTTAGGATC GTTTAAAAAT 720
TATTTTGCAT TATGACATTA TTTTTTGACA ATTAAACATT CATTCATGTT CCTTCGGCTT 780
AGTTATAAAT ATATTTTATT TT 802