EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-32018 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:5124947-5126929 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ASCL1MA1100.2chr3:5126374-5126384GGCAGCTGCC+6.02
ASCL1MA1100.2chr3:5126374-5126384GGCAGCTGCC-6.02
ArMA0007.3chr3:5125756-5125773AGGAACACTCTGTGCTT-6.07
BHLHE40MA0464.2chr3:5125997-5126007GTCACGTGAT-6.02
EGR1MA0162.3chr3:5126751-5126765GATGCGGGGGCGTC-6.05
EGR3MA0732.1chr3:5126751-5126766GATGCGGGGGCGTCA-6.13
FOXK2MA1103.1chr3:5126355-5126366ATGTAAACACG+6.02
Nfe2l2MA0150.2chr3:5125592-5125607TGCTGAATCACTGTG-6.21
RREB1MA0073.1chr3:5125910-5125930CCCCAACACACACACGCACA+6.15
SOX15MA1152.1chr3:5126895-5126905CTATTGTTTT+6.02
SREBF2(var.2)MA0828.1chr3:5125997-5126007GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr3:5125997-5126007GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr3:5125997-5126007GTCACGTGAT-6.02
Enhancer Sequence
TACATGTTTG GGAAGAATTT GTGCTTAAAT ACCATCATCC ACGCCAATAA AGCTTGTTTG 60
TGAAGTTTAG CTAATTTCAC TTCAATATAT GCTCTGGGTG TGTTGAATTA ATGCGCAAGA 120
TCTAATCAGA AAGTAGATCC GGCAAGAAAA AAACGCGTCA CGGTGGAGGG CGGAGCACGC 180
GCGCGTCGCG ATATAAATGC GCGAGCCTGT CAAACACAGA AGTTTCCACG GGCGCGTGCG 240
GGAGCGGGGG ACGCCGCCAA TTAAACACTG AATTATAAAC TAATAAACAC AAATAAAATC 300
GCGAGTGAAG TGCGTTTCAG TCAAACGCAA CACACCGCAG CGGCTCTCCG TGAAGGACTT 360
CCCAAACGCC ACAAGCACGC AAAACTGCTG ATACTCACCT GGAAACCGTA AAAACAGGAT 420
AAAAACACAA CATTAGCATC TGTGAGTATT TATTTTACAT TATTTATATG CATATTACAT 480
TAACCACATT CATTTGATGA ACGCGTCCTG CATGAACACA TTAATAATTG TTGTTTATAT 540
ATTTAAACTG GTCAGCTGTC GTCCATTTTA GAGTGTTTGA AGAGAAAACA AATATAAAAT 600
AATACAATAA TGTGAAGCTG TTTAATAATA TATGGAGCAT TAGCATGCTG AATCACTGTG 660
TTGGCGTTTT AATTCGGGGT AAATGTGTTC GCACAGATGC CCTTGGCTCG CAAACAGGCC 720
AAATGTTTGC AAAAGCTGAT TATTATATCT GCTGTCGGTG TGTAAACCGA GCTGCTGCAC 780
AGTTATAAGC TCATGTCTGG AGTTACTCGA GGAACACTCT GTGCTTTAGA CATTTTGTGA 840
ATCGTCCAGA AAAAGTGCAA CATATCTGCA ATTTATCATG CATATTGGTG TTATTGATCC 900
TCTTGTTTTA ATTGTTGCTT GAGATATTAG ATTGCATGTT GAAAAACCTT TTTACAAGGG 960
AGTCCCCAAC ACACACACGC ACACACACAC ATACTTGCTG ATCAGTTGTG TTTGTGTTGT 1020
CATGTAACAC TCATCACTGA TAGTGTTTGG GTCACGTGAT GATGTTTCCA GGAGCACCGT 1080
TACTAATAAT TGAAGCTGAT CGAGATAAAG GCGGGCGATT CATTATATTC TGAGTGATTA 1140
TAAGCTGATT ATGAAGCTGA TTTAGTTTAC ATGTTGTGAA TCTACTAAAT ATGTGGTGAG 1200
TGTGTGTGAT TTTGCTCTTT AAGGAGTGTG AACAATCAGG CAGTCTGCTG AATGAGTTGG 1260
TTTGCTGCAA TTAATTAACA TGTTTGTCCC CTGTCAGGCG CGTTCTCGCG GTTGTTTTGA 1320
TAAACTTTGA CATTGAGTGA CATTGAATGC ACGATATCAG TGTTTGAAGT CGACACGAGA 1380
TTGGTTTAGT GAATCATATC AAATGTAAAT GTAAACACGT TAAATGTGGC AGCTGCCCAT 1440
ATCAAGGGGA TATTAGAGGT GTAATAGTTA TTATAGACAA CATCGCTATT CACGGGTTAA 1500
GTATAAATGT TTAAACTAGA ATAAAATTGT CTAATTTTTG CTTTGAAATC GTGTTTTAAA 1560
TTCGTTAATG ACTGATTAAT TTATTAAAAG TGCTGTTGTT ATTATTATTA TTATTTCTGA 1620
GCCAGTTTAT GAGCGCGTTA CTGAATAAAA CAACCGTTTT AATAACATTT ACCGACAGTG 1680
TGACCGTTGT CATCTGTGCT GAAACTCCTC GAGGATCTGT TTTAAGCAGA AACATGTCGA 1740
GTGCGGTGTT TGTAATCAAT ATAATTGTTA AAAGTGCTTT AACCGAGCTT ATCAGTGTTT 1800
TGAAGATGCG GGGGCGTCAC ATCAACATTC ACACGCGTGC TGATGACGTC AAACACCCTG 1860
GCGTGCTGCA TGCTGGGAGT TGCAGTTTTT CAACGCGCTT ATACAGCACC ATTTTATCAG 1920
CTCTTTAGTA AGGATGAACG CCTGGTTACT ATTGTTTTGT GGCAGCAGAT GTCATTTTGC 1980
AG 1982