EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31985 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:3598296-3598887 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr3:3598369-3598382GATTAATTAATTT-7.82
MEF2CMA0497.1chr3:3598397-3598412TGTTATTTTTAGAAA-6.17
POU6F1MA0628.1chr3:3598370-3598380ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:3598370-3598380ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
GCAATATTTA ATGCAGATAA AGCATTTATG ACCTTATAAA TTACAATTAG ACTCCAATAT 60
AAACAGCTTT AACGATTAAT TAATTTTAGC TCAATTAGTG ATGTTATTTT TAGAAAGATA 120
AATCTAAAAC ACATAAAATG ACCAAAATAA AGACCTTAAT GGCTGTTAAT GTCCCATTTG 180
TAGAGCAAAT TATAATAAAA ATAAATGACA TGCCTTTTCT AAAAAACTAA CAAATAATAT 240
CGATAACACT GAAACTCAAA ATCCTTTTAT ATGTGCTAAC AACAATTAAA TGCTAACCAA 300
AAGACCGTTA ACAACTATAA ACTTTCACAA TAAACAGTCT TTTTAAATTT CTCTGATTAA 360
CATATCAACA ATACCTTGTG CCCTTCATCA GCCAGGAGCT AAAAGTCAGA AAAAACCTTT 420
TTGACTGCCT TTATGATAAT CTTAACAGAG AGCACTCCAA AGTCCTTTCC TTTTTAACGC 480
TAAACACTTC ACCTATAACT TCTTCAATGT GCACACTACG GTCTGATTTA AGACAACAGC 540
ACCCTCTACT GGATGGAGGC AGAAGTGTCC GTGATTTAAC AATTTAAAGG T 591