EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31962 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:2025443-2026804 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr3:2026641-2026653AAACATATGCTA+6.32
NFYAMA0060.3chr3:2025713-2025724TCTGATTGGCT-6.32
TBX19MA0804.1chr3:2025591-2025611TGTGACACTTACATGTGACA-6.01
TBX19MA0804.1chr3:2025591-2025611TGTGACACTTACATGTGACA+6.29
TBXTMA0009.2chr3:2025593-2025609TGACACTTACATGTGA+6
ZSCAN4MA1155.1chr3:2026783-2026798CGCACACACTGAACA+6.07
ZSCAN4MA1155.1chr3:2026437-2026452AACACACGCTGAAAA+6.71
Enhancer Sequence
CAGGAAATTT AAAATAAGAG ACTTATCATG TTTATATCAG CTCAATATGA CTGTGGACAC 60
ACAATACTAC ACACAGCTTT GTCCAAACAG CAGACAAAAG AGGACTTTCA TTATAGGGTT 120
ACCTCTTCAC ATAGTGTAAA CGCAACATTG TGACACTTAC ATGTGACAAA CACAGTCTGG 180
CGTATATTAA ATGGGTGTAC ATGTGAATTA TGGCGATGCT GAACAACACA GCAGTGTGTG 240
TGTGACACAT TTCTGAGCGT GTAGGTTCAC TCTGATTGGC TGAGAACAAA ATCATGACAG 300
CGCACATCGC TACGCTCTCT GCATTTCTGC ATTAATTATG TGTGTGTGTG TGTTTGTGTG 360
TTGTCCTGCA TATCTGCATG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGCTGAGAGC 420
TGAGGCTGAT TTCTAATTCC CCTGATTTAA TCATCTGTGT GATACTTTGG TCAAACAAAG 480
AGACTCATTG AGCTCCGGCT GAGCGAGGGG AGGGAGGGAG GGGGTCAGAC CTGCAGTTTC 540
ACTGAATACA AAGACACACA CACACACACA CACACACACA CACAGAGGGA GAGAGAGAGA 600
CGTGCACATA GGCAGAGATG CGCACACACA TTCTCACATA CACAGTAGCA TGTACACACT 660
CACACTGAAC ACAGAGAAAA TCACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 720
ACACACACAC ACTCACATTG AAAAGACACA CATATACAGA GGCGTGTACA CACTCACATT 780
GACACACACA TGCCTATACA GAGATATGTA CACACGCACA AAGACATGAA CACACTCACA 840
GACATGTACA CAATCACGCT AAACACACAC ACACACACAC ATAGACAGAC AGACATTAAC 900
ACACTGAAAA ACACACACAT GTACAAACTC AAGTTAATTA CACACATACG CACACACAGA 960
GACGAACACA CACACACATA TAAACACAGA CATTAACACA CGCTGAAAAC ACACTGAACA 1020
CACACACACA CACACACACA TAGAGACATG TGCACAGACA TGAACACAGA TATATATACA 1080
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACAGATGCG CACACAGAGA CATGTTCACA 1140
CGCTAAACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAA 1200
ACATATGCTA AGCACAGACA CACACACATA AACAGAGATG CAAACACACA CACACACACA 1260
TATGTACACA CTCACGCAAC TAGAGCTAGC AGGAGAGAGA GACACACACA CACCCATGCA 1320
AATGCAGAAA TACACACACA CGCACACACT GAACAGACAC A 1361