EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31922 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr3:662341-663100 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BATF3MA0835.1chr3:662566-662580TGATGACGTCAGCT-6.31
BATF3MA0835.1chr3:662566-662580TGATGACGTCAGCT+6.57
ELK3MA0759.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
ETS2MA1484.1chr3:662871-662881ACTTCCGGTC-6.02
ETV1MA0761.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
ETV4MA0764.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
FOXB1MA0845.1chr3:662399-662410AATGTAAATAT+6.32
Lhx3MA0135.1chr3:662919-662932GATTAATTAATGT-6.03
POU1F1MA0784.1chr3:662963-662977AATATGCTAATGAT+6.58
POU3F2MA0787.1chr3:662964-662976ATATGCTAATGA+6.27
POU3F3MA0788.1chr3:662963-662976AATATGCTAATGA+6.11
POU4F1MA0790.1chr3:662917-662931ATGATTAATTAATG+6.04
POU6F1MA0628.1chr3:662920-662930ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:662920-662930ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AATGGCGGCT CTATTGACGC ATTCCTTCCT ATAGACAACA ACAGGGTAGG CGACATCTAA 60
TGTAAATATC TATGGTAGTG CACAAACAGC ATTCAAATTC AAGTAAATGT ATTATTTACT 120
TGATTTTCTT TCATATAAAG CTAAATCTTT CGAGCGTTTA ATTCCTCTCG TTAATATTAA 180
ATCTATTTCA AAAAGCCTAA AACTAGCGCG GTGTTTATGA CGCGCTGATG ACGTCAGCTC 240
GCGTGCGTCC TCCCCTCAAA TCGCTCCGTG CGGAAACTGG CGGCGCGCGC GTGGCACGAG 300
CGACCGGAGG AACAGACACA GATCAGACGC GCCGCTGCGC TCCGGTGTGT TGAATGAATA 360
AATAAACCCT CGACGCGTTT ACCGATGACC GCGAGCACTG CACGGTGAAG GTGAGCAACC 420
GAGGATTTAG ATCCGCATCA CACACATACA CACACACACA CCGCTGCAAC ATCTGCACTG 480
CTCGAGATTA TACTGATCAT CATAATAATC CGGTGTCGTG AGTGAGGGGT ACTTCCGGTC 540
ACCGATAATC TCAGAGCAGT GCTAGCGTTA GTAATGATGA TTAATTAATG TACTATAGTA 600
GAGCACACAG CTGCTGGTGA TAAATATGCT AATGATGTGG TTTCCTGATG CCTGCATCAT 660
CTCTCCGGAA CCCTTCTGCT CTGGATATTA GTATGCTGAT GTGTGGAGGA CCCGAGCTCT 720
GACCTGGTTT ATCAGCACAC CTGCGCTACA GTCCCGCTG 759