EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31831 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:35796160-35797590 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr25:35796615-35796626GATTTAATTAA+6.02
LMX1BMA0703.2chr25:35796879-35796890GTTTTAATTAA+6.14
LMX1BMA0703.2chr25:35796882-35796893TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr25:35796616-35796629ATTTAATTAATTT-6.07
Enhancer Sequence
GCAAAGGCGG TAAAGGACTC GGAAAAGGAG GTGCTAAGCG TCACCGTAAA GTTCTCCGTG 60
ATAACATCCA GGGAATCACC AAGCCCGCTA TCCGCCGTCT CGCTCGTCGT GGTGGTGTGA 120
AGCGTATCTC TGGTCTGATC TACGAGGAGA CTCGCGGAGT GTTGAAGGTG TTCCTGGAGA 180
ACGTCATCCG TGATGCCGTC ACCTACACCG AGCACGCCAA GAGGAAGACC GTGACCGCCA 240
TGGATGTTGT GTACGCGCTG AAGAGACAGG GACGCACTCT GTACGGCTTC GGCGGTTAAA 300
CATCTGCAGC CCATCCTGAA ATCCCAACGG CTCTTTTAAG AGCCACCCAC ACTTTCATAA 360
AGCACATTTC TAATCTTTTA TGAGTTTTTA AAATGTTAGT TTTTAAAATG TTTTCTTATT 420
TTCAGAGGTT CCAAATGGTT CAATCCCAAA TTTTAGATTT AATTAATTTT TACTGTAAAC 480
ATGGAGCAGT TATGTAAAAT AATTAGATAT AAGGCAAGTA TTAAAGTACT GCACTTCAGA 540
GGAGACATGA CGTATTATGG GCGCCTTTGA TTCTAATAAT TTGTATAATT TCAAATACAG 600
ATGTATATTA ATGGATGAGA TGTTCAATGT AGTTTACTGA GTTTAATAAA TGAACAAGTA 660
CAAGATCACT AGATTATGAA ATATACAGAC AGATGACATT CCAAAAGGCA GTAAGCTAGG 720
TTTTAATTAA AATTACCTCC TAGCAAATAA CTTTAGTCAT ATATTCGGTA ATGAAAACCC 780
CAAATTGCTT ACAGATAATT AAACTTTTAG GGGAAGGAAA TAAAACACCC GTTATAAATG 840
AATAATTTGC TTCTGTTACA GCTATTCTGC TCTGTATTTG TCTGAAATAG TTCTTCATTT 900
CGGGTAATGG AACGATTTCG CATGACTATT ATCGTAGAAT GACTATTGTA AGATGGTGCA 960
ACAACCATAA CATTTAACCT ACAGCTGCAT GTAAGCTTTT TGCATTATAG CGGGGGAAAG 1020
GTCAACAGTA AAGGAGATCA CTGGGAGTTG ATTATTCAAA TTTAGAGGCC TGCGATTGGC 1080
GGAAAGTTTA TCTAGCCGCC TAATTCTGAC CAATGAGATC TTCATTCGTT GAGCGAAAGC 1140
ACCCAATAGA AATACAATGC AGTCACTCGG CTTGGCACGA GCTTTCAATA AATACCCCTT 1200
ACAGTGAACA GAACCACACT CGGTTTCGCA CTCTGAAATC TTCATCATGC CTGAGCCAGC 1260
AAAGCCCGCG CCCAAGAAGG GATCTAAGAA AGCGGTCACC AAGACCGCTG GAAAAGGAGG 1320
AAAGAAGCGC AAGAGGACCA GGAAGGAAAG CTACGCTATC TACGTCTACA AGGTGTTGAA 1380
GCAGGTTCAT CCCGACACTG GTATCTCCTC CAAGGCGATG GGCATCATGA 1430