EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31806 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:35502797-35503501 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU1F1MA0784.1chr25:35502824-35502838AATATGCAAATAAG+6.92
POU1F1MA0784.1chr25:35502888-35502902CTTATTTGCATATT-6.92
POU2F1MA0785.1chr25:35502824-35502836AATATGCAAATA+6.37
POU2F1MA0785.1chr25:35502890-35502902TATTTGCATATT-6.37
POU2F2MA0507.1chr25:35502888-35502901CTTATTTGCATAT+6.57
POU2F2MA0507.1chr25:35502825-35502838ATATGCAAATAAG-6.57
POU3F3MA0788.1chr25:35502824-35502837AATATGCAAATAA+6.04
POU3F3MA0788.1chr25:35502889-35502902TTATTTGCATATT-6.04
POU5F1MA1115.1chr25:35502825-35502836ATATGCAAATA+6.02
POU5F1MA1115.1chr25:35502890-35502901TATTTGCATAT-6.02
Pou2f3MA0627.1chr25:35502823-35502839GAATATGCAAATAAGA+6.09
Pou2f3MA0627.1chr25:35502887-35502903TCTTATTTGCATATTC-6.09
mix-aMA0621.1chr25:35502978-35502989ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
GTGCTGCGAT TTGTTGCTAA CCGTATGAAT ATGCAAATAA GAAGATAAAC AGAAGGGAAG 60
TCATTTCCTG AACGGATTTC AAATGTACGT TCTTATTTGC ATATTCATAA GGTTAATAAC 120
AAATCGCAGC ACGAGAGTGG ATGACGTGCT GACTTTGGGA ATATCTCGAA TTAACTGATT 180
TACTAATTAA TTAAGTCATT CATGTCTCTA GTTCACTCGT TTATCGTTCT TCGTGTTTTA 240
ACCGTTTTCC CCTGAAAGGT ATACGAAGCT CATGAATATG TAAGTAATAC AGCACAAAGC 300
CAGTTTTTGA TTGGTCGACG CACTCATCAC CTTCATTCGC TGATAACAAA GGTTTATTTT 360
ATAGTTTATT TTAAGTATAA TAAACTAAAA GTTACGAGTT ACCCTCATCT TTAAAAACTA 420
CACAATAATA ATCGCTAAAT TAAACGACAG AGCAGGATTA CAGTGTGCTG AAAGCTGTGG 480
TCGGCAGATT TGTGTTAGTC TGAAGCCGTT TTCCTCTCTG AGGGAGATTT CGCTGTGAGA 540
TCCTCGTGTG TGTTTATAAT GAGTAATTCT GAATCACTCA TGTCGTCTGT CTGCCCATTG 600
TGTGATCTGA TATTAATATA ATCAGCTCTA GACATCATCA TAACTCTGTG ATATTCGAGT 660
CCACAGACAG GACAGACTGT TTTATGCGTC ACGTGCTTTG AAGT 704