EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31572 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:29129849-29131133 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr25:29130905-29130916TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr25:29130898-29130911TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr25:29130899-29130912AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr25:29130902-29130915TAATTAATTAAAT+6
MTF1MA0863.1chr25:29130290-29130304GAGCCGTGTGCAGA-6.31
PHOX2AMA0713.1chr25:29130906-29130917TAATTAAATTA-6.62
POU6F1MA0628.1chr25:29130900-29130910ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr25:29130900-29130910ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr25:29130906-29130917TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr25:29130906-29130917TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr25:29130906-29130917TAATTAAATTA-6.62
ZNF263MA0528.1chr25:29130452-29130473ACCCTCCCCCCTTCCTCCTTT-6.55
Enhancer Sequence
TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCCTAT CTATTGACAG TTAATCAACC TATCTATCTA 60
TCTATATATC TATCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCGGTCTGTC TGTCGGTCTG 120
TCAGTCTGTC TGTCTGTCAT CTATTTATCT TTGTGACCAC AAATCCATTT ATCCATCTTT 180
TTGAACATGA ATCAATCAAT TCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT 240
CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCAGATC AATCAATCAA TCAATCAATC TGATCACCAA 300
TCAATCAATT TATGTCTAAG TCTATTATAG ATTACCTTAG TTACTTTAGA TAAACCCAAA 360
TGATTTACAT AAGCAACTAT GTCTGGATGA AGTGAGGGAA ATCCTCAATA AATAAATAAG 420
ATTACCAATC CAGCATTACT GGAGCCGTGT GCAGACGCAT GTCTTTAACC TGATGACTGA 480
GTCGTTTGTA TGTGCAAAGT AGGCGAATAA AGACTCTCTT TTCTGGGTCA ACTCCAAACC 540
ACAGTGTTGG TAATGAACAC CTTATGTATG TCAAAAGAAG AACTTGAATG AAGCCGCTTC 600
CTGACCCTCC CCCCTTCCTC CTTTCCCTTA TGCACCACAT TCGGTTGCAT TTAGACTCAT 660
TCATGACAAA TGGAGACCCC AGCCCCCCTC CCATGTGTCC CATAACAGCT GAATGAGCAA 720
CTTTCTGGCA AAGCGAGGGA AAACACAAAA TCGGTTTGAC ACGGGTGTTG AAAATTGAGT 780
CATCAAAATT GTTTATGCAT CATCAAGAAC CGTTTGAAAA ATATGAATAA TCCATCATAA 840
AATATGAGTT ATTACATGTC ATTTTATCTT CAGAAGATGA ATATTTTAGC TGAAACTGCG 900
GTTCTTTTGT GATTCATTAA ATGCAAGTGA ACAGTTACCA GCACTTTGGA AAAAGATAAA 960
GGTAGTATCT GTGGATTTTG GTACGCTGTA AAATTTACTG AAAGTTAATT CTACTCACTT 1020
GGAAAGAGTT TTGAACTCAG TGTTGCAGGT AATTAATTAA TTAAATTACT TAAATGGATT 1080
AGTTTTTTAA CTTAAATGGT TTGTAGCAAT TAGTTTCCTC AAATGGTTTG AGTTGCTTTA 1140
ATTTATTGGG TTTTACAGGA CTCAGTTGGT TTGAGTTCTC TTCATTTATT GGGTTTTACT 1200
GTGCTCAGTT GCATCATTTA CTCAAATATA TTAAGTTGAC AGTACTCATT AGGATTAGTT 1260
TTTTAACTTA AATGGTTTGT TGCA 1284