EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31423 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:25748323-25749139 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr25:25748598-25748615ACTGATTAATTAAATCA-6.36
CTCFMA0139.1chr25:25748764-25748783GGGGGCCCCCTGGTGGCCA-6.93
CTCFMA0139.1chr25:25748533-25748552AAGCGCCACCTGGTGGCGG-7.24
CTCFLMA1102.1chr25:25748765-25748779GGGGCCCCCTGGTG-6.43
FOXA1MA0148.4chr25:25748485-25748501GTTTGTTTACATAACG-8.27
FOXC2MA0846.1chr25:25748486-25748498TTTGTTTACATA-6.74
FOXD2MA0847.2chr25:25748487-25748500TTGTTTACATAAC-7.04
FOXK2MA1103.1chr25:25748486-25748497TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr25:25748486-25748497TTTGTTTACAT-6.14
IRF7MA0772.1chr25:25748726-25748740ACTAAAACGAAAGT+6.18
LMX1BMA0703.2chr25:25748603-25748614TTAATTAAATC-6.02
ZNF384MA1125.1chr25:25748869-25748881GTTAAAAAAAAA+6.04
Enhancer Sequence
CGCGAGCGAT ATAGCGAAGT GAAAGCGCGT CTGTTAGAAA GAAACTAGTG GCAAATTCGG 60
GGGAGCTGGA TGTCTGAAAC ACACAAATAC ATTGGCCCAG CTTGGACAGA AGAAAGTGTC 120
TGTATGCCTG AGATATTCAC CATTGCAATC ATCTGTCTTT CAGTTTGTTT ACATAACGCT 180
GGGGTATGTC CGATGATCCG CCATTACGGG AAGCGCCACC TGGTGGCGGC TGGGTGTACT 240
GTAGCTAAAG CGGTTATCTG TTGTCGGGGT TGAAAACTGA TTAATTAAAT CAGATCTTTT 300
GTAAATTTAG GTAAATATCT TGGCGCCTGA GTATGTATCG CGTCATAAAT AACACTATAA 360
ATGGGCATAT AATTTGTCCC ACCACTAATC CACAACTTGA CAAACTAAAA CGAAAGTCAC 420
ACAATAATTT TAAGCACTCT TGGGGGCCCC CTGGTGGCCA CGGGGCCCTA AGCAGCCGCT 480
TAGTTCGCTT ATGCCTTGGG CCGGCTCTGA AATAGAGGAT AACTTTTTGT TAAACAAAAC 540
CTGTTTGTTA AAAAAAAAGC TGTTTGTTAA CTTGATGGAG CAGAGAATAA CCATGTGTAT 600
AGACTGGTCT GTATGGTTCT TTTGATAGAG TGAAACTCAC AAAATTGAGG TTGAGCTGAA 660
AAGATTCAGT CTGGAGTGAT CTGATCTTTG TATTCAGGTA GCTTCAATGT TCATCAGGGT 720
TGCAGTCAGT TGGGAATTTA TGACGTCCGC TGAGTGACTT CAAATTGCTG TTGAGCTGAA 780
GATTCCGTCT GAAGAAGTTT CCTTAATCTT GAAGGT 816