EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31377 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:24475073-24476071 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr25:24476028-24476049AAAGTGAAAATGGAACTGACC-6.42
IRF1MA0050.2chr25:24476022-24476043AACCTGAAAGTGAAAATGGAA-6.49
ZNF384MA1125.1chr25:24475748-24475760TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr25:24475749-24475761TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
CCCAACCAAT ACTGTTTTCA AATGCAAATT ACTATAGAAA AGCGTGGACC ACATGCTTCT 60
ACTGCAACCT CACACTGCTT TTATTAGTTT GGTTCTCCCT GGTTTCTGGA ACCATCCTTC 120
ACCAGACTGT TGAGCCACCA ATGGTGAGCC ACCGATCAAA CTTTGGAAAA TGCCAACATG 180
TAGCGATCAT TTTGCACACA TTTTATGCCA TGTGTACCAG TGAGCACATA TTTGTTGGTT 240
CTCAAAAATG TTACCCTGGG CACATTTTCC CAAAGAGCCT GTGGGTTTAG TTTTTTTATG 300
TGTTCCCGAA AAGTTGTTCT GCACCATGGG CCTTTATAAC ATGTTTGCTT TAACCAGCCT 360
CAACCACAGC ACTGCAATGT TCTGCCAGTT CCAGAAACTT ACTATTTAAA CTACTTTTGA 420
ACTACTAGCC ATTGATCTGT GGCACAAAGG AGTTTTGATG TTTTGACAAA CTTTAACTAT 480
ATTTTTTCTA GAGACATTCT GTGTTAAGAC ATGTCACCTT GTACTGTACT TTCCCTTTTG 540
CTCATTTGTT GCCAGACTTT TAATCATTAG AATAAAGGCT TTTGACTGTC AGGTCTAATT 600
TGCCACATCA TCTGGCTAAA ACAACCACTT ACAAAACATT TAATGCAAAA GTCCCAAGAT 660
TATGGTGGGA GAATCTTTTT TTTTTAAATT GAGATTTATT TTCCAGGTAC CACTCAAAAC 720
CGGATCTGGA ACAAAAGAAA AGTTCCATGA TGAACACTAC AAAAAGCATT ATTAGTAACA 780
ATTTTTAATA TGACATATTT AATTATGGCA CAATATTTGA CTTTGATGTT GCCATTTTTA 840
CATAAAAAAT AACACAAGCA GGTTAAATTT AGGATAGGTT AATAACCTCT AAGCAGGGCC 900
GGAGCAAGCT GAACTGGCGA TCTAGGCAAA AGATGATTGC GCCGCCCTCA ACCTGAAAGT 960
GAAAATGGAA CTGACCGGTT CGTCAAGTGA ATAAGGGG 998