EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31279 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:21051293-21052511 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NEUROD1MA1109.1chr25:21051891-21051904GGACAGATGGCCT+6.41
RORA(var.2)MA0072.1chr25:21051794-21051808GTGACCTACATATT-6.01
RORCMA1151.1chr25:21051795-21051807TGACCTACATAT-6.37
Enhancer Sequence
ATATTTAGAG GAAAATGTGC TTTATGCATT TTAAAGCTTG AAGCATTAGT ACTCTTGGTA 60
CTCTGTATCG GCTGATCAGC ATGATAAGGA ATCGTTACTT GGTATTGGCT GCAAAAATGC 120
TGATCAGAGC ATCCCTATAA TATATAGTAT TACTTTAATA GATTTTTAAA CAAAATATTC 180
AGCACATTAA AACAAAAAGT AGCCATTATA AATGCTGTCA AAGGGCCATA GAAACCTTTT 240
AATAGTTCAA AGTTAGAACA GAAGGCTAAA TGGATTTACA CGGGTCTGTT AAAGGGATCA 300
AAAGCAGGGC GAAAGCCAAA TGCAGGACAA CTGGGGTAAA ACTTAACAGT TGCTGGAAAG 360
TCAGTGGTAC GCAATAGCAA CCATGACTCA ATTCTCTGGC TAGTTTAGAC ATAGCATTTA 420
ATGTGGTATA TTCACTTGGA CATATACAGA AACTTCAGTA AAAAAGAAGC ATCTGAGAGC 480
TATTTTCCTT TTCTATTTGT GGTGACCTAC ATATTGTTCA AATGTGTTTA GCATGTGAAA 540
AAAGGAAAGG AGACAAATGT GGGAGGGGAA TATCCCTGAG TTTAACATAA GGCGCCGAGG 600
ACAGATGGCC TTCTCGGGGA AGATATACAG GCCCTTCCCT TTTTTCTGCA GCACTGTGAA 660
CTCACAGCTT GGAACGCATA GCAGCATATC ACAAAAAGAC AAGCTGAGAG ATAAAAACAA 720
GGACAGTGAA ATGCGAAAAA AGGATATAAA TGGAGACTGA AAGCTAAAGA GAGAGAGAGG 780
CCTTTGTTTC AACTATGTAT GAGCTGGCTA CGCCTGAGGG CCCAAAGCAA GAGAATTGCA 840
GCTCACGTGG TGCTGCTTCG TCATCGCTTT GCACAAAAAA AAGAAAGAAA AAAAAAGCAA 900
CGAAAAAAAT AGGCAGCAGG GGGTGGAGAG AAGCTGTAGA GTCAAGCCGT GGCAAACCAG 960
CTCGAAATAC TTCACACAGG AGATTACCAT TGCTTTGGTG GTTGAACTTG ACCCACTTTT 1020
CAAATCACAC CTCTCGATAT GTTCTCAAAA CTGCTTCTTC ATGATAAAAA CAAAACCGAG 1080
GTTGCCTCTG AATGCATGAA GGCTTGTTAG AAGTGAGCTG GTGATTTTCC GATGGAGGTG 1140
CTGTTGCTAA GCAAACCTCG TGGAGATTAG TCATGCTTTT ATCATATCAT AAACTAATAA 1200
AAGTCGAAAG ATTGCAGG 1218