EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31276 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:20993165-20994626 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFLMA1102.1chr25:20993231-20993245CGCGCCCCCTGCCG-6.51
DPRXMA1480.1chr25:20994354-20994364AGATAATCCC+6.02
SOX4MA0867.2chr25:20993447-20993457CCCTTTGTTC-6.02
Enhancer Sequence
TAACGGATCG ATGTGCTTGT TTACGTTATT CATTCTCCAT GTGTTCCTCA GCAACACAAC 60
ACAGCTCGCG CCCCCTGCCG GAGCATCTAG AAAAGAGCAT CGCAAAAGAA ATAGGCTACT 120
ACAACAAAAG ACTTGTCTTG CATCAGGCTG TCATCATTTG CTCACGCGGC CGTAAGAGCT 180
TTTTCTAGGC TCTTAAAAAC ACACAAACGC ATCCCAACAG CCTCGACCTA AATACGTGAC 240
TTTGCTTTAT GTTCCACTTT CCCTGAAGCA TCGCGTCAGT TTCCCTTTGT TCAGTGAACG 300
TGCCAGGACA CGCGCCACGG TGTTTTACCG GAGCAGGAGG AGTCCATTTC CCTTTTTAAA 360
GTGCAGACAG GTAAAACGAC AACGTCTGGG TAACACCCGA GAAGGATATC TGAGAGGAGA 420
GGGCATCTTT TTCCACGCTG GACGGACAGA TATCGCTTGA ATGCACAGTT AAACGTAGTC 480
AGGAATCAAA CAATCCGCAT CATTTTCAGT TGCTCACATA TTCCATCAGT ATAGCTGTAA 540
GTTATTCATG GCGGGATTGA CGCACTGGGT ACTCAATGTA CCTTGTGGTG AACATGGCAC 600
GTTTGTTATT CATAAACAAC GCAACAATGC ACCATTCATC CGAGGGAAAA CGAAACATTA 660
CATTAAACCC CGATTTATTT TCAGACTCCA CGCAAACGGT AACAATCTTT GAACTCACCG 720
TCATGTGCTC CGCGTGCAAA GTGAATGTGA GCAGTCGGAG ATACTGAAGG AAGTTCAATG 780
CGCGCGGATA CAATAGAGAT GATGGATTAC ACTTCGGGAG TAACTAATCC ATACATGCGG 840
ATGTTGGGCT GTGCGGGGTT AATGGATCAT TCCTGTGGCA TTCCCAATTC TCGCCCCTCC 900
TATTCGCTTC TTCCCGAGTT GCAGACTGTC TGACCAGACG CCAGTCCAGA CTGTGGGCGC 960
GTTCACGCCC GAACACGTGC GCGCGCGCCA TTGTGCGAAG GGTCAAAATG TGCTTTAAAT 1020
GAAACTGGAA AATGCTCATT TAAACTAGGG TCTCGAAATT TTTAATAAAA GCAAACGCAG 1080
GAAATAATTT ATGAGCTCAA TGGTTAATGC TCAATCCATA TTCAATCCAT ACAGTGACTG 1140
CAGGCTGCAA GCAGACCTCA ATCTTTATTC GGATCCCGTA TTTATATTGA GATAATCCCT 1200
GCTGAGTTGA CAGTGACGGG GATGTTCTTT TGCAAACCAA TAAATAATCT TGAAGAGGTG 1260
GAGTAGAGAA CTCAAATGTT TTAAATACAA TTTTACATTA TTTCAGCAGT GCTTCTTCTC 1320
AACTTATTTT TTCTTCTTCT CAACTTATTT CTCAATTCTT TTTCCCCCAA AGGAATTTAA 1380
AGGGCACCTA TGATGAAAAT CATCTTTTGT AAGATGTTCG GACAGAACTG TGAGTAGGTA 1440
TAGTGTGTCC ACAGTCATAT T 1461