EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31182 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:18298995-18300539 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr25:18299055-18299068AAGGTGTGAAATG+6.92
FOXA1MA0148.4chr25:18299487-18299503GTCTGTTTACTTAAAG-6.06
FOXC1MA0032.2chr25:18299385-18299396TAAGTAAACAT+6.02
FOXP1MA0481.2chr25:18299487-18299499GTCTGTTTACTT-6.52
FOXP2MA0593.1chr25:18299488-18299499TCTGTTTACTT-6.32
NR2F2MA1111.1chr25:18299432-18299443CAAAGGTCAGA+6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr25:18299435-18299452AGGTCAGACAGAGGTCA+7.54
Rarb(var.2)MA0858.1chr25:18299435-18299452AGGTCAGACAGAGGTCA+7.79
TBR1MA0802.1chr25:18299056-18299066AGGTGTGAAA+6.02
TBX21MA0690.1chr25:18299055-18299065AAGGTGTGAA+6.02
TBX2MA0688.1chr25:18299055-18299066AAGGTGTGAAA+6.62
ZNF384MA1125.1chr25:18299188-18299200AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:18299186-18299198ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr25:18299187-18299199TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
ATCAGCAAAA CCCGGAACAG AGTTTTGGAC ATCTCTAAGA TATCACATAC ACCTATTTCA 60
AAGGTGTGAA ATGAGTGGCT AAATTTAGCC TATACCAAAA AAAGATTGGC ATCTCCTTCT 120
GATTGCTTCC ATATGCTACA GTGATGGATA ATTGTTAGAA GTGGGGAAAA ACAAAAAAAC 180
ACTGGAAGAT CATAAAAAAA AAAAATAAAA ATAAAAATGC TAAGGCATGT CCAGAATGCA 240
TTGGAACTTG AGCTTTGGGA CTGACACCTG ACCCCATTTC TGCCTCGAGG GGGTCAGCGT 300
GGGTCAAGGG AATGATGGGA AAGCGTACCG GCAAGAGAAG AGGCGGATGT TTTCCAGCGA 360
TGGCTTGGAA AAAATGTAGA CACACTTGGA TAAGTAAACA TGAGAGAATC ACCTACCCCA 420
TTCTTCCATC ACCTCCTCAA AGGTCAGACA GAGGTCAAAC AGATCCCTCT TACTGCAAGT 480
TAAAGTCAGA GTGTCTGTTT ACTTAAAGTA ATCAGGCAGC ACAGATCCCA TAGTCCTGAG 540
TGGGCGTGAA CAACTTTTAT CTTAGAATTA CGACATTGTC CACAACAGAA CAATTTGTGC 600
AATTGAGCAT TTCCCCAACC CAAAGTGCGA TTAACAATAC AGTAATTTCA AATTTAAAGC 660
AGTTCTTCCT GTGGTATCTG ATTCAACAAA GGCTCCTGCT GTGTGACCCT CATAATGACT 720
TCACCTACTT GTGATCATCA CTTGGCCTAC TGACCCCTTT TTAACCCCAT TACTCCAGAA 780
CACACCTGTT TTTTCACTCT ATATGGTGGA GATCTAATAC AAACACAAAT ATACACTTGG 840
CAGGACTCAG CTACCTAGGC TATTAGATTG GTGTTAACTT AAGTCCACAA GAAATGAATG 900
GGAAATATTA AGCAATATGA GAACACAGAG ATGATTTGGG CTACAATCCA CAAATCAGCC 960
CCCAAATCTT TGTCTCCTCA ACGGAGTTCA TTTGCAAGTG AAAACCACCT CAACAAAGTT 1020
AACATCTCAA AACTCATCCA CTTTCCATTG GATGACTAGT TTGTCATCCC TCCCTTCCCT 1080
AGACCGCATG AAGGGTGATA ATTTGGAAGC ATTTAGTTTG TCTAGCCAGA TTTCAGTCCT 1140
AATTATTACC CGTGTCTGTG CTTCATACAA TTTCTATGCA TGATGTAAGC CAGGGGTCAT 1200
CAATCTCGGT CCTGGAGGGC CAGTGTCACT GCAGGATTTA GCTCCAAATT GCTTCAACAC 1260
ACCTGTCTGG ATGGTTTAAG TATACCTAGT AAGACCTTGA TTAGCTTGTT CAGGTGTGTT 1320
TGATTAGGGT TGGAGCTAAA ATCTCCAGGA CACCGGCCCT CCAGGAACAA GTTTGGTGAC 1380
CACTGATGTA AGCCCTCAAT TATGTGTTAG TATGCGATAG TATTCATTTT GATTCGCAAA 1440
ATTGACAAAT GGGACATGGT TGAGTGGTAT GGAAGTGGAG TGAGCAATAA TCACCTGTGT 1500
ATACCACACT GGTCCCAAGT CCTACAGAGG AAGTGCCAGA TAGG 1544