EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-31111 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:16796390-16797312 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr25:16797233-16797254TTCCTCTTTCTGTTTTTTTTT+6.29
NR2F2MA1111.1chr25:16796927-16796938TAAAGGTCAAA+6.32
RARA(var.2)MA0730.1chr25:16796930-16796947AGGTCAAATAAGGGTGA+6.24
Rarb(var.2)MA0858.1chr25:16796930-16796947AGGTCAAATAAGGGTGA+6.28
ZNF384MA1125.1chr25:16797245-16797257TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr25:16797246-16797258TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
TCTTTCCTCC TCTGATCTTA AATTTAAATC TTAAATTTCA ATATAATTCA AGTAAATTGG 60
GTACAAATTA GTGTTGAAAA CCACTGATTT TCTCTAGATG AACAAAGACT GTTGGTTGGT 120
GCATTAGGGA GCAGATTAGG ATGAAGGGTA CATTTAGGGT TGACGTATGG TGGTAGAAGA 180
TTTTGGCCTC AGGGTTGGGA GTTAGAGGTG TGAGAACGGC CTGTCCTTAT GTGCAGTTTA 240
ACCTGATCTG GGCCATTATA GCTTGCTTTT TTTTTTTGGC TAGTGAAATG AGATGGTTCA 300
GGGGGTTGGT GGGTGGGCTG GACAAGAGGA GGGGATGGAG AAAATACAAT CCTGAGGTGG 360
TTACTGATAT GAATCTGTTC TTTGTTTCAT ATCAGTGTTG GGCTTCTGCT CAGGGGGGCT 420
GTGTTTAGTG TAGTTTGGGG CCTGAAGTGA CAGTATTTGG TGTCTTAGAG GAGGATTTCT 480
ACCCCGAATT GGGGGTTTTC CATCACACGG GTCAGAGTAA GGGAAAAAAG AGCTTTATAA 540
AGGTCAAATA AGGGTGAAAA GTAGCTGATG GAGTTAAAGA CCTTGGATGT ATTGTGCTAT 600
TGAATTTTTT TCGGTAAGAT TTCAGATTTT CTATTTGTAT AATGTCTGAA ACTCTTTCTT 660
CCATCCTGCT GTTGCCTCAG AGCAAATTGT GCATGCTGTG AATGAAATGT GTGTGTATGT 720
GTGAAATCTG GCTGCTTTGA AAGTTCAAGG GCGATGAAGT CATGCTTTAG CTACCTTGAG 780
AAGAATTCCA ATGTTTAGAA TTTGTCCATG AATGCTGCAC AATTTTCACA TATTTCTATG 840
TTTTTCCTCT TTCTGTTTTT TTTTTAAAGA AATAATGTGC AAATATAATT TTGAATGCTA 900
GTTATATGCG TATTATAGGG TT 922