EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-30937 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:12387790-12389006 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata4MA0482.1chr25:12388365-12388376GAGAGATAAGA-6.32
RFX1MA0509.2chr25:12388225-12388241TGTTGCTATGACAACA+6.64
RFX1MA0509.2chr25:12388225-12388241TGTTGCTATGACAACA-6.65
RFX2MA0600.2chr25:12388225-12388241TGTTGCTATGACAACA-6.45
RFX2MA0600.2chr25:12388225-12388241TGTTGCTATGACAACA+6.59
RFX3MA0798.1chr25:12388225-12388241TGTTGCTATGACAACA-6.14
RFX3MA0798.1chr25:12388225-12388241TGTTGCTATGACAACA+6.46
RFX4MA0799.1chr25:12388225-12388241TGTTGCTATGACAACA+6.32
RFX5MA0510.2chr25:12388225-12388241TGTTGCTATGACAACA-6.18
RFX5MA0510.2chr25:12388225-12388241TGTTGCTATGACAACA+6.4
Enhancer Sequence
CACAGCAAGA ATACTGCCGG CCCTAGTTCC ATAGGACCGG TGGGTGTTTC TGTGGGGAGT 60
TTGTATGTCC TCCCCGTGTC CGCGTGGGTT TTCCCCGGGT TCTCCGGTTT CCTCCCACCA 120
TCCAAAGACA TTCAACATAC ATAACAATCA AGCTTGTCTA ATCCCTTACG TTCCCTTAGC 180
TACAGCAGCA GAGGAGTTCT GAGGTCCACC GAGCTCGGGC TCCCTTCTTG CTCTGCCAAC 240
GGGAGGAAGC CCCGGGCTCG AGGAGCCCTT GAGCTCGGGG CTCTCTCCCG GGACAGCATG 300
CCAAATGAGC TTTGTAAATC ATCAGCTAAG TGTGAACTCT TGAAATGGCA GCTATATTGA 360
TGCATTCCTT CCAATAGACA GCAATAGCAT AGGCAACATC TAGTGTATAT GTCTATGGGT 420
TTGAGCTGCC AGACCTGTTG CTATGACAAC AACACTCGGA TGAGTTTTGA AGAACGAAGC 480
AATCCTGGAT CGAGTTGTAA GAAATGAGTC TGCCTCGACC CAACTTCCAC TCTAAATGGT 540
GAATTGATGC TCATTTCCCA AGAGGACTGA CTTATGAGAG ATAAGAGAAG TCAGCAGGGT 600
CTTGTCTCTG CATCGTTTGA GGTGACTACA TCTCGACCAA ATGGTAACAA TTGTAGAATG 660
GGGATGGGTG TGGTGCACAG AGAACCATCT CATCAATGGT GTTGAAACTG CGTTAACATG 720
AAGAGATAGG GAGAACAGCT GGGTCAAAAG CCAGGGAGCA ACTTCATTAA TATCTTAAGG 780
CAACATCAAA AACAATATAA AGGTTTGAGT TTAGGAATGT TCAGGGTTCA TTCTGACCAA 840
GGTACTGCCA TGTATTTTGA GACTGCTATG CTGAATAAAC ATCTTCATTG AGATTTTCTT 900
CGTCATCATT TTTTCTTACA GAGTCAAAAC ATCAATAACC AAATCCACAT ACGAAGAATG 960
GACCCCTGGT ATTTAGTTGC GTTTTAATTG ATTCCATCAC ATGTAGATGA GGGTGAAGGG 1020
GACACCTTGC ATTTTAATCC TCTAAAGCAG TGCTTCTCAA ACTTTTTTCA CCAAGTACAA 1080
CCTCTGAAAA AAATGTTCTC TCCAAGTACC ACCATAATGA GCAGTCCTGA AATACAGTAG 1140
CGTAGTAGTA GCCCGGTAAA GCAGCTACAG TTCTGCACAG TTAAAAACTG TGGCAGATTA 1200
ATTCCTATTA TTAAGA 1216