EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-30661 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:3520927-3522395 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA9MA0594.2chr25:3521321-3521331CGTTTACGAC-6.02
RFX1MA0509.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.41
RFX1MA0509.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.41
RFX2MA0600.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.37
RFX2MA0600.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.37
RFX3MA0798.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.39
RFX3MA0798.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.39
RFX4MA0799.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.07
RFX4MA0799.1chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.07
RFX5MA0510.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA+7.49
RFX5MA0510.2chr25:3521351-3521367TGTTACCATGGTAACA-7.49
Enhancer Sequence
AACATAAAAC TAAGCAGAAA ACATTACTAA TGTACGAAAT GAAAACATTT TAATGCTTAT 60
TTTTTTCCTT TGATGCTTGA AATCCAATTT TCGCCTTTGT CTCCTATACA GCGTATTACA 120
TAAGAGGTAA ATGTGACAAA TATAACACGA AAATACAACA TTATTGTGTG TTAAGCAAAG 180
CTCATAATCT CAATGCTCAG ATCAATCACC TCAACACGTT AATCTGCAAT GGTAGTTAAA 240
CAGAATAACA TTACGAGCTT GCAAACTCAC CTACATCGTG GTTTCGCTGC AGGGCGTCTA 300
TCACTGATGT TTTAAAAAAA TAAATAAACA TTAAATATGT TTAAATGATC TCCGTTATCG 360
AGTATGACAC ATAAATGCTG CTCAAACGAT TAGCCGTTTA CGACGCTAGC AAGCTAGCTG 420
CTTCTGTTAC CATGGTAACA GCATGACGCT CATCCTGATC CTAATAATTC ATTTTAAATT 480
GAGTGCCAAA TAAATAATAG TTGAGAAAAC AGAACGGATT ATTTAAATAC ATTTTAACGT 540
GTTGAATGTA TGTTTAATAT CACAAATTCG ACTACTCTAC GAGCACGGAA CTCGCTGTTT 600
TTTCCTCTGC ATTCACACGG AACGTCGGAC ACCAACACGT CACTAAGTAG GCGGAGCTTT 660
AGGGTTTCCA TCGTGCATTG GACGGTTTGA ATCAATGACA GACATGCGTT TCCTCCAATA 720
AGTACACAAC TTGCTTTTTC CTCAAACCTG ATTGGGTAAA TCTGTCTTGA CGGACAGCAG 780
TACTGTCCAA TCACACTCAA GGATTCACTG AAGCGACCGT TCGTAGCTTA TTATTCGTCA 840
AAGCAGAATT TAAAACTATT TAAACCGTTT TGAGCGGGTG CCTAGAAAAC AAGAGGCAGC 900
CTAGTCGAAG AGAGAAACTA GCTTCTAATG TTCAATTAGC GACTAATGTT TATAAACAAA 960
ATACAAGGAA GGATCGTAAC TTCGGATCGT CGGATTGTTA TTTTTGCAGC GCGATCGTGA 1020
ATAAAGGCTA AAGAGGTAGA TGTCGATTTA ACGTTACGTT TTATTATGCT GCTTTTTACG 1080
TTAGCCAAGC TCGCTAACGT TATCGATTCT TGAAAAAGCC ACATCTGTAC TATAATCGCA 1140
TGTTATGTTG AGTGTTTATG TTATTTTTAA TGCTAAACCT TAGATTACAA AAGATGAAGA 1200
ATAGTGTCCT TTGTTGTTGT AATATTCAAT CTTTTTCATC TGCGTCTGTC TGTTTTGGGT 1260
TGATGTTGTT GAAATGTTGA TTTTATTTAT TCAATGAAAC GTTAAAATAA GTTAAATGTG 1320
TTTATATTTG TTTATTTGGT CAAACTAAAT GAACGAAGAA AACATCTCAT GCTTTAACTA 1380
TGAACGTGTG TTAAATATTG ATTAGTATTA ATCATTTGTA ATTCTAAAAT AACATCTAAC 1440
GTTAATATCT GCCACTAAAA TGATCTGA 1468