EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-30657 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr25:3344000-3344958 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr25:3344213-3344223GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr25:3344213-3344223GTCACGTGAC-6.02
LMX1BMA0703.2chr25:3344412-3344423GTTTTAATTAA+6.14
MITFMA0620.2chr25:3344209-3344227CGCGGTCACGTGACCTAC+7.07
MITFMA0620.2chr25:3344209-3344227CGCGGTCACGTGACCTAC-7.08
NRF1MA0506.1chr25:3344266-3344277CGCGCATGCGC-6.02
NRF1MA0506.1chr25:3344267-3344278GCGCATGCGCA+6.32
USF1MA0093.2chr25:3344213-3344224GTCACGTGACC+6.14
USF1MA0093.2chr25:3344212-3344223GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr25:3344209-3344225CGCGGTCACGTGACCT+7.01
USF2MA0526.2chr25:3344211-3344227CGGTCACGTGACCTAC-7.03
Enhancer Sequence
GAGCAGAGGG AAAAAAACAC TCTGGAACAT CACAGCTTGT TCTGCTGGGT GTTGCGCAAT 60
ATGTTCTTTA CTGCTGTTAG GTCACGTTGA GCGCTTGAAG ATTCATGTAA AATCAACTGA 120
GAGGCATTTA AAAGACGTGA ATCCTAGATT CGTCATGTTT AATAACGCGT TTTGTTTGTT 180
GCGGACACAC TGCGCCCGAT TTTGTAAAGC GCGGTCACGT GACCTACATT GCACGCAAGG 240
CTTGTTTATA AACTTTTTCT GGACTTCGCG CATGCGCAGC GCAGCTCATT CATTCATAAC 300
TGCGTAACAA CGGGAGATCA ATAACAGCGA TAGATTGCGC TATAAAATTA ATCATAAGTT 360
TTGAAAATCA CAGATTGAAG TCTCCCCGTT CGATTCAATC AAAAATATGT CCGTTTTAAT 420
TAATTGTAAG CTTTATTCAA AGACATTTTA TTCACTCGAC GGTTTCAGTT TTTCACACAG 480
GAAGAAAATA AGATTTTTCT GCTTTCGCGA ATAAACGCGG AACAAGATAG ACTAAAGCGC 540
GTATGTGTTT TAGTTTATTA TTGAGATGTT AGCACAAATA ATGTCGCTTT ATCAGCACAG 600
CACGAGAACA ATAACTTCAA CACGGCTGTT GCAACAATAC GAAGGTCTTT GTTTAAAAAA 660
AATCGCCCAA AATTACTTAA CAACTTGAGC ATTTCATAAA AACATGCCTT ATATAAGCTA 720
TCCAGCTGTC AGATGTTCAA TCCATGTCAT TAAATGCTTA AAACTGAACT CAGATGTCCA 780
CGGTGCGAGC TGTAAACAAA AGAATGTCAA CAAGTTGAGA CATGGTACAT TAAGTCCTTC 840
CTTTTCCCCC ACTGCAATGA ATGGAGACCC TGTTTCCTTC GGGGCTTTAT TGAAAAAAGA 900
CAATGGTTTA GTTTAATTAT TGCCTCTATG GAGAGGTACT GCATTACTAA ACCACAAG 958