EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-30360 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:38085989-38087281 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK2MA1103.1chr24:38087121-38087132TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr24:38087121-38087132TTTGTTTACAT-6.14
Lhx3MA0135.1chr24:38087260-38087273TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr24:38087264-38087277TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr24:38087268-38087281TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr24:38087261-38087274AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr24:38087265-38087278AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr24:38087262-38087272ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:38087266-38087276ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:38087270-38087280ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:38087262-38087272ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr24:38087266-38087276ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr24:38087270-38087280ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr24:38086748-38086768TGTTTTGGGTTGTGTTGGGG-7.44
mix-aMA0621.1chr24:38087258-38087269ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
TCCATCCATC TATTCATACA GCTATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCTTCTA 60
GCCATCCATC CATCCATTTA TCTATTCATC CATCCATCCA TCATTCCATC ATCCATCCAT 120
CCATCTGTCT GTCCGTCCGT CCGTCCGTCC ATCCATTCAT CCGTCTGTCC GTCCGTCCAT 180
CCATCCATCC ATCTATTCTG TTTCTTTGCC TCTCCTGTAG GTAAATACCT GATTTTCTCT 240
CAAGATTCAA TAAAACTATA AAATTTTCTG CATTCAGGCT GTGGAACATG TTTAGTTCTA 300
GCTGGTTCTT TTGAAGTGTA TTCTTTAATT CTGAAACAGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 360
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 420
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTCTGTTTGG TTGCTTGTAT CACATTTTGG ATGCCAAATG 480
TATAGCAATA TCAGTATTTT TTGCCTTTTG AGGATTTTTT TTTTCATGAG GAAAAAGTGC 540
CTCATAAATC ATCCATAATT AAATCTTTAG AAAATAAACT TCATCTGAAT GTTTTCTGTG 600
AGGGTTGGTT TAGGGTTGGA TAAAAGGACA GTCTGTACAG TTTAAAATTG TTATGGGAAA 660
AAACATGAAA ACCAAATTGT GTGTATGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 720
GTGTGTGCAC GTGCACACAT GTTTGTTTGA CTGTGAGTGT GTTTTGGGTT GTGTTGGGGG 780
TGTTCTCATG TTTTGGAGGG AACTCTCTCC ACTCATTGTT GTGAGTGAAT CCTGCTGTCT 840
TTGTGTTTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 900
GTGTGTGAGG TGTAGTTACC TGCAGTGTTT TCTATTTAAT ATCATTTAAA TCACTTTCCA 960
AATGCTGCGA TTACGTGCAT GCAAAAAAAG TATTGTATTG TCGTGCATCA AAACATCAGT 1020
CTTATGTTGC TTAGCATTTG TTTAATGATA TAATTGAATG ATTTTTTTAA ACAAAATAAA 1080
ATATAACTGC ACCTTTTTTA TCCCACAATT CCCCCCCCCT CCCCTCAAGA GTTTTGTTTA 1140
CATCTCTCTC ACGATTAAAA CTAGCTCAAC TACAACATGC AAAATCACGA AATAACGTGA 1200
GAATTAAGGT CATAGCTGAT ATAAATAAAA TATAAGAAAT ACAACATGTG AAATAATGTT 1260
TGACGTCACA CTAATTAATT AATTAATTAA TT 1292