EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-30293 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:36382357-36383397 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr24:36382812-36382822GTCACGTGAT-6.02
MITFMA0620.2chr24:36382808-36382826TTTGGTCACGTGATCCCA+6.35
MITFMA0620.2chr24:36382808-36382826TTTGGTCACGTGATCCCA-6.35
SP1MA0079.4chr24:36383355-36383370AGTGGGCGGGGTTAC-6.29
SP4MA0685.1chr24:36383353-36383370GCAGTGGGCGGGGTTAC-6.01
SREBF2(var.2)MA0828.1chr24:36382812-36382822GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr24:36382812-36382822GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr24:36382812-36382822GTCACGTGAT-6.02
USF2MA0526.2chr24:36382808-36382824TTTGGTCACGTGATCC+6.58
ZNF384MA1125.1chr24:36382880-36382892TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr24:36382879-36382891TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
GTCGACGTGC ATTTACCTTT GTTTACCACA AGTCGCATTT GTATATAGCT TTAATCCACG 60
TGCACACAAT GTGACTATAC CTGTCCAGCA GATAACAAGC AACATCCGCG TCATTCCTAA 120
AGCCTTTCTT CTCCTTAAGA GCTTTCCATT TTGAATAAGC TATCCCGATG TTTACTCTGT 180
TTATCTGCTT CTCTCCGTCT CTCTGTCGTC TTATCCCGTT AGTGTAATTT CTTCTTATCG 240
GCATAATCTG TTCCATTCTT GCGGCTAATG CATAACCGTG GTCCATCATT CCTTCACAAC 300
ACCTTGCAGA GGTACTTTAA CGCGATGATT CTGTCGTTAA TATCCCAGAA AACCCGTTAA 360
ACAACTAAAC AAATAAGCAG TCATTGTCGG TTTATAGAGT TTGCCGTTTC GCCCATGAAG 420
GGTTTCAACG TCAGCCAATG AGTAAGACTC GTTTGGTCAC GTGATCCCAA AATGGCGACC 480
ACTATTTTGT TGTATATTAT TTTTTGTTAA TTTAATGCTT GATTTAAAAA AAAAAGAGAT 540
ATTTATCCAA GTCGGGTAAC AGTTAGCAGA GGCACCTTCG CAGAGGTCGG CCACACTGTC 600
TTGCCAACCA GGTACCACTA AATGCAGTGT AAACGCGAGT AACTCTTTGC ATGTAGAATT 660
TACTTCAAGT AAGTTATTCC TACTAGAAGC CAGTATTATA ATACTTGCCG ATTACTTACC 720
TGTCAAGGAG ATAGGTGGCC AACTCTATGT TTGATTTGAA GCCTTTCTCT CTTTTGAGCT 780
GTTTCCACCT CTTTATTTCA TCTCCAATAT TTATACGGCC TTTATTATAC CGTTGATCAT 840
TTTTTATTTT GGCGGGATGC CGAGGCTTTT TAGGATATTC AGTCTCTGAC TCTGACCCCT 900
GTTGTTCGGC AGCTTCCATG ACTGAAATGA ATTGAAAGAT GCGGGGTTTT CTGTCAGCTG 960
GCAACCCGAG GTGCTGCAAT ACGATTGGTT TAACTGGCAG TGGGCGGGGT TACATGGACC 1020
GAAACTGACA CATTGCGACC 1040