EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-30236 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:34983914-34985384 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr24:34984301-34984314TTTAAGTGTTTTT-6.64
SOX4MA0867.2chr24:34984462-34984472CCCTTTGTTC-6.02
STAT1MA0137.3chr24:34983987-34983998TTTCCTAGAAA-6.14
Enhancer Sequence
CTGAATTCTG AGTCTTCACA TACCATGTCA ACACTTTCAA TTCCATAGGC TCTTCAAGGC 60
TGTTTTTTTT TTCTTTCCTA GAAATACTAA CATGTAGGCT ATTTACACAT GTACACTCTT 120
TTTTTTCTTC TCGAAAATAA TACATTTACA AAATACACAG CAAAATTCCC ATTTACAAAA 180
TCTAATTTGT AAATTGAAGA ATACAACACA CAATTTGTGA ATTCACAAGT AATAATCATA 240
AATAATTTTG CCAAATGAAT TGGATTTGTG TGTTTTTGAA TCGGGTTTTG AATTTACGAA 300
CTGGATTTGT GCATTTTTTA ATTGTGTTTT GAATTTACGA ACTGGATTTG TGTATTTTTG 360
AATTGTGTTT TGAATTCACA AACTGGATTT AAGTGTTTTT GAATTGTGTT GTAAGATTTG 420
AGATATTCCA AATATTTGAA TGTCTTTGTC AATTCAAACA TGAGCCGAAA ACAGAGAAAA 480
TTGACTCTAC AACCCAGCCG GCGGGAATAC GGGAAAGAAC CAGCTCCTCC TCCATTTACA 540
TTTGAAATCC CTTTGTTCAA CCACCCCAAC TTACACAGTA TGGTCATTTC AAAGTCTGAA 600
TGTTCTATAT CAACCCAAGT GACGTTATCT ATCATGTTTG ATGTCATTTG AAATGTTGCA 660
GTGCGAATGG TACAATGTTC TTATTCCCTC AGAAATAGAC ATAATCAAAA CAATAAATAT 720
ATAACTTCAG GTATCTTTTG CACCACTGTG AAGGGTGTGC CTTTCTCACA GGCAGCACTA 780
AATGCAAATA CCTTTTGTTA TTCACACACC CCTTTCCTTA AGGGGATTCT TGGATTACTT 840
AAGGGAAGGT TTGAAAAATG TTCTACGGGA TTCTGCTTAC CCAGATAAGC CCATGTATAT 900
TTTGAAGTCA GGTATGCATC TTTTAACCTT GGATTTATCT TTGAAAATTT GATGTTTTGT 960
ATTGATCGTT TATGAATTGG CATAATACAC ATTTACCTGA CTAATAAATT ATGTTTTGAA 1020
TTATTTAAAC AGAGTTTATG TTATTATCTA TTATCTCTAG TAGATTACGT TAAGTCCATA 1080
GCACTACAAG CCCCTGTACA GGTTAGTAAT GGACTAAAAC ACATTAGACG GAGCAGTGTG 1140
GCACGCTATA CGATGTCCTT AAAGATCCGA CTAACATATT TGTAATTAAT TCAAGTATAC 1200
TTACTGTAAA AGGCCAATGA TGGGTTTTGT ATTTAGAACA AAATATTGTT GAGACCAATT 1260
TAAATGTGGG TAAGTTAGGC CTTATACAAC TTTTATAATA TACTAAAATA GTTTGTCTTG 1320
ATTCAGTAGA TAACAGATCT ATGGGGACCA CATAAAATCT CCTAAATTGA GTAAGTAGGG 1380
TTCTGCCTTT TTAGGATAGC GGTTAATCGC CTCTGTTTAA TGACCAAGAC TGACAAGCTT 1440
GTGTTTAAGA GATTGTATAC TCGGCCGGTA 1470