EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-29954 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:25632070-25633104 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr24:25632921-25632933GAATGTTGGTTT+6.04
Foxd3MA0041.1chr24:25632210-25632222AAACAAACAAAC-6.32
MEOX2MA0706.1chr24:25632274-25632284GTTAATTACT-6.02
Enhancer Sequence
CCGAATGATC TTTTGGAGTC AAATGAGTTT GAAGCTAAAC TATTATGTGC CTCAACAGAA 60
AGACAAAGAG ACTATTGCAG ACAGCCAGAG ACAGGAAGCC AAGTGAAAAA TATCTGAATA 120
AGCCGCAATA CAAAGCATCA AAACAAACAA ACCAAAAAGA AAGAGGCGTT CATGCAGACG 180
ACTGGCTATA ACTTACAAGC GCATGTTAAT TACTCATTGC ACAAGTAGCT TTTGTTGGCC 240
CAGTTACTTC CATTCAAAAC AAGGCACTTT AAAATTTATT GAACCTTTGA GCTAGTTCCT 300
CACAGAGTAC ATAAAAAGCA TAAGATCTTT CGCAAACAGG ACAGAACAAA GCTATTCAAC 360
CCCCTGCCAA ACTAAATCAG ATCTCTGGAG CTGATTACGT TTGTTAAGAA ATGCTGAAAA 420
CAGCTTGATA AGAGTGATGC AATGCCAACT GAAGGATACA GATCCAAACG GCTTTGGCAG 480
CACTCCTTAA ACAATGGTAC AGGCCGTTAA TGCGTCCGAT CGCTTCAATG TCAGTTACTG 540
ATTATTAAAA TCTGCAGTGT AAGCAAATCA GCTTCAAGGG AGAGGCTGTA ATGATGTCAC 600
TTTGATAAAA ACAAGGAACA CGTTTCAAGC AGGATAAGAG AAACAAACAG GCTTTGAAAA 660
CGATAGAGGG ACTGAGAACA AGACAATAAA TGACAAACAA GTGATCAATT ATAAAGGGTG 720
GGAATAAGCC TGAACATTAA ATATGCTAAA GAAACCCCAA CAACACCCCT TTCTATATGT 780
GAGAGACAAT TATAATTTAT AGAAGTATGC GAACCACCAT TGCAAAAGCC AATAAAAAAC 840
ATGAAACACT GGAATGTTGG TTTGTTATTG GTTTCTAAAT AGTCTTATTG GTTTGTAGTC 900
TCAGTAGCCA ATTGTTCACC ACACAAAACC CAATTGTGGT TGGTGCAAAC CCTTGCTATA 960
AATCAAAATG TATTGGCCCG AACTTGTGTA GTTCTGCTCA TAGTAGTGGG TTCCTGATGC 1020
TAGTGTGTAC CAAA 1034