EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-29937 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:24998641-24999789 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr24:24998775-24998786ATATTAATTAA+6.62
LMX1BMA0703.2chr24:24998778-24998789TTAATTAAAAT-6.62
TWIST1MA1123.1chr24:24998666-24998679GATCCAGATGTTT+6.62
ZBTB18MA0698.1chr24:24998666-24998679GATCCAGATGTTT+6.67
Enhancer Sequence
AGTACTTAAC AATTATTTAC AGTAAGATCC AGATGTTTGA ACTTGAACTC GTAACATGAA 60
AGTTTGGGAA TATTAATCTA AAGAACCGGA AAAAAATATT TCTCAGTTGT TGAATATACG 120
TCACGTACGC CAGTATATTA ATTAAAATAT CGTAATAATA CATTGTAAAT GTAAAAAATA 180
TATTGAATAA ATTTAAGGAC ATAAAATACT TTAACACACA ACCACATTTT CACGAATTAA 240
TTATCAAGTG ACACAAATGA CGTGACACAC CGATGTGAAC GAGCACGTCG TTTATCGTAA 300
CAGATGTAAC TTCACAGTCC TTGCAGCGTG TTATAGTCTA ATCCACACAA TTATCTGGAA 360
AGAAAATGAT GAATGGTAAA AGGAAGCAAA ACAAACCTTT CAGGAAGTCC CATTAAGCGA 420
GTACCTCAAA ACATTAGCGG AGGTCTGTAG CCAATTAGTG TTTCACGCCG AAAAGCAAAG 480
GCATCATGTA AACTCGCGTG CGTTTCTCCG TCCGCTCGTG CGTCTCACGC GACCGCTTCT 540
CTTTCCTCCA CTACTGTCCT GAGGTCAGTG AGAACAGCAC AAACGCTGAA AACCCGTCCT 600
AAAGGGGTGG TGCTCTGTAC ACACTCAAGT ACAACTTGGG AGGGAAGTCT GGCTAATTCG 660
CTGAAGCTGT TGACGCTTTT AAACGTAAGT CAAGACTTTT AATTATCTGC CTCAGTGATG 720
CATTCAACTG TGAACACAAT CTTGATACGT ACACTGCTTG GTGAAGCAAA CTCGTGAGTG 780
AAAGGTGATT TAACCCCTCC CCCTCTACTT TCTTTGTCTG CCTACTCAGA GATAAAGTTA 840
CCTGAGAGAA ACATTAATGA AATGAGTTGA GGTCAGACAC TGCTTTCAAG ATATAGTGCT 900
GAACTCTGAA TGATGTGCCT GATGAGTGAT ATTTTGTGCA ACTCTGTAAC TGAAATCAAT 960
TGTTCCACTT GCACAAGACT AAGCATATCA TCTTGTTCAA GTTTTTGACC TTTCTGCATC 1020
ATCATGTGAA TGCCAGCACA GCTCTACCAA CCTTCATCAA TCATGATGCA GACGACAAGA 1080
AATCTGATTT CAGGCAGGCT CAAAAGTCAA TGGTATAAAT AGATGTTTGT ATAAAATCGA 1140
GAAGGGAA 1148