EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-29838 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:23084607-23085869 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF7MA0834.1chr24:23085237-23085251CTGTGACGTCATCT-6.13
CREB1MA0018.3chr24:23085238-23085250TGTGACGTCATC+6.02
CREB1MA0018.3chr24:23085238-23085250TGTGACGTCATC-6.02
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr24:23085238-23085250TGTGACGTCATC+6.14
Foxd3MA0041.1chr24:23085620-23085632GTTTGTTTGTTT+6.32
JDP2(var.2)MA0656.1chr24:23085238-23085250TGTGACGTCATC-6.32
JUNB(var.2)MA1140.2chr24:23085238-23085250TGTGACGTCATC-6.11
NFYAMA0060.3chr24:23084832-23084843GGCCAATCAGA+6.02
NKX2-5MA0063.2chr24:23085301-23085311CTCAAGTGGT-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr24:23084963-23084976GTTAAGTGGTTAT-6.87
Enhancer Sequence
CTCATTCACA TTCATACACT AAGAACAATT TTAGCGTACC CAATTCCTAT ATGTATACAA 60
ATGCCAGATA AATAAAATTT CCCACAAATT TAAGGGACAA GAAAATCCAC AGCACAATAA 120
AATTACACTA TGAAAAACTA ATTAAACCTT ACACGTTTTA TTTTTGCAGA ATTGATGATA 180
GCAATAGCCA ATTACACACG TTTCTGTTGA CTTTAGGAAC AAAATGGCCA ATCAGAGGCG 240
TCACAGCTCA AATCGCTGGA GAAGTTGAAA CCGGTGAAAC CAATTAAAAC GTGCGCCCAG 300
AGTGACTGTT TTCACACGAT ATTTCTCATC ATAAACAAGT TACTGGAACG ATGTAAGTTA 360
AGTGGTTATT TTCGCTTTGC TGACAGCTTC AGTGATTATG AGTTTCATTT TTTGTCAGAC 420
TAACGTCGAC GAATGTGTTT TGCCTGTGTA ACATTAACCA CATTTTTAAC GTTAGCATGA 480
TTCCTCATGC CGTCATGGGA GAGGATTTAA GAAAATTTTG TTTGTGGATA AAGAATTTTG 540
CATATGATAT AAAAAAGATA AATATATTTT CTTAATTTTT ATTATTGGGA CTAGAATATT 600
AACAATAATT ATTTTGTGTG TAATTCAGGC CTGTGACGTC ATCTATTGAG CAGCTATTGT 660
GATTTGCCCA TCATACAAGA TCATCTCAGA AGCCCTCAAG TGGTAAACAG GTTAGAGAGC 720
AAAATGCTTG TAATCCAAGC CCCGTGTTTG GAAATGAGAG GGTCTTTTGT GTGATGCACT 780
GCTTTGTCAT TTACATATGG CTGTGCTCTT TGTAAATATG CAGCAGGACT CAAGACAGGC 840
ACTGCCAAAA CACACAAGAG CTCTCTGAGA ATACAATGAC TGGCCTCTTG TTCAACATCT 900
TCACAATGAA TAAATGAATA ATGTTGCACC AGAAGAAGTC GGTAACATCC ATGCGGCACT 960
CGTATATTCA GAGTCAGAAT ATGCATATTG AAGAAATGCT TTTTTTTCTT TTTGTTTGTT 1020
TGTTTCTTGC TTTTTTACGC AGAGTGAATG TAGGAGATGC TTGCTTAAGA TTACTATTTT 1080
CAAACATGTT TTTGTAAACT GAAAAGTAAA ACTGATAAAC TTAAAATACA TTTTTTGATT 1140
TATTGTTTGA CATTTCAATT AATAGCATCA GACCTTTATA CAATAAAATG AAAATGAACA 1200
TACTCAAATT CTTAAATCCA GTAAATTCTA ACATTCCAGT GGCCACGTAT GTTTTTATAG 1260
CT 1262