EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-29661 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:18340698-18341851 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr24:18340819-18340838CGTCCACAAGATGGCAGAA+6.11
IKZF1MA1508.1chr24:18341735-18341747AAAACAGGAAAT+6.11
IKZF1MA1508.1chr24:18340920-18340932ACTTCCTGTTTT-6.74
Enhancer Sequence
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACTCTGACT TTACAGTAAT TGTTTGGTAG 60
AGGCCACTGA ACTAGGCTAC ATCATTTTCA TGAATTCTTC ATAAAAAGAA ACGATCCCTA 120
CCGTCCACAA GATGGCAGAA CAATTTCACG TTCGTTGTCA GTCACGAGTC ATCAAATGTG 180
CCTGAAGGCT CTTTGAGCAG AACCACATTA AAACTAGTCA TAACTTCCTG TTTTGGCAGA 240
CAGAATTCAA CAAAACATCT CTGTGTTTGT TTCTGCTGCA TCCCAGACTC CGTCAGCTAA 300
ACATCAAGCA GCCTTTGGTG GAGTTTCTTT CTCACCTCAC GTGGAGTAGA CTACAAAGTT 360
TGCATCGAAT CGCGACAGCT GGGAGCGATT TACGGCTATT TATAAAGACT TATGTCAACA 420
TTGGTTTTAC TCGAATACTG AGGCTTTACC GCACATGTGG TCACTGGTCA GTGATGCACA 480
AGCAATAAAC ACTGCTTATC GCTAAACCAA ATAGCTTTCT CATTCCATCA CACTCATTTA 540
AGGGAAAGAA ATCGTTTCAT ACAAACAAGC TTTATTTACA GTAAAGGGTG GGGAAATCAC 600
TAGTCGTATA TAACGATTTT TCTAAATCAC TAGGCCTTAT ATACATTTAG TGCTTGTGGA 660
AAATGTCCAT ATACATATGT TCTGGTTCAG TCAGACTGAC ATGTCGGATA AACTGCACAA 720
AATGACAAGA TAAATAACAG AAATAAAATT TACATTTCAA AATTAGATTT TATTCAAAAA 780
ATAAACACCA CAAATCAACT TCCCTGTTTC TTATTTTCAT TTTACTTGCT TAAAGAGATA 840
GTTTACCCAA AAACAAAAAT TATAGACCAT TTCCATGTGG TGTCATTGGC CCATGAACAT 900
TTCCTGCTTG TTATCAACTT CATATCTGTA ACAAGAGGTG ATTCAATCAG AACTTGATGT 960
TGTAACAGCT ATCGTAACAT TATTTGTCAA TATGTGGAAC TTTTTGGACC CTCAGAAGCT 1020
ATGGAAATTT AAAATATAAA ACAGGAAATA CGTCAGGACC ATTAAATTCA CCAAAATGGT 1080
CTACAAAACA ATTTTGATTG GTTGAGCTGC TGTAAAATAC AAATATACAG TTCTTGGCCA 1140
CCATTACTCC ATC 1153