EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-29645 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:17433839-17435090 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr24:17434061-17434074AAATTAATTTATT+6
PBX1MA0070.1chr24:17435000-17435012TATGATTGATGA-6.11
PBX3MA1114.1chr24:17434183-17434200CTCACTGTCACTCAGAA-6.08
Enhancer Sequence
TATTTCCACA TATAAATGAG GCCAGAAACT GATCTGAGTA TATTGTAATA CAGGGGCATG 60
GCTCAGATTC TTGGCTAAAT GCAAAAACAG TGTATGGAGG CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT 120
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCACGTGGT GTGCGTTTGG GTGAACGGGA GCTGAGCGTC 180
TTTTGGAGAG CGTGGCTTTT CTTACCTTTT TTTTTTCCCC TTAAATTAAT TTATTTTTCC 240
CCCCCCCGTT TTCTTTGTAG TTTATGTTTG TTATTTTTGT ACCTAAATAA CGTTTAAACA 300
ACATTTAACG CCGCAATGGC GGCTGATCCC GAGCAAGGGA CGCCCTCACT GTCACTCAGA 360
AACGGTTGCA GGTGTGTACC AGAGCCGGGG GTGACAGTGG AGGAGCTGCT TTTGATCTTT 420
GGAGAACAGG TAGGCTTTGA GAATATTCTC TCGGCCTCCC GCATGAACAA AGCTGTTGTT 480
GTATTCCTTA AATCGGAATC TTTAGTTAAT CAGCTGATTG TGAGTGGAAT ATGGGTGAAA 540
GAAACGTTTG TAAGGGTAAA CCCGCTGTCC ACTCCTGCAA CAAAAATCAC GATCTCGAAT 600
GTTCCGCCTT TTATTTCAGA TGAAATGATT ACGAAAGAGT TGCAAAGGTT TGGGAAAATT 660
GCAGGCCCCG TTAGAACGAT CCCCCTTGGG TGTAAGAATG TCGCTTTAAA ACATGTTCTC 720
TCGTTTAGAC GTCAAGTTTA CATGTTTTTG AATTCACCGG ACCGTATATT AGACGCGTCT 780
TTTCGCGTAA ATCATGGGGA AAATTCCTAC ATGGTTTTCG CTAGTACTGA AAGCATGAAG 840
TGCTTTCAGT GCGGAATTTT TGGGCACAAA CGGTTTTTTT TGTCCAAATA AGGATGGAAA 900
ACAAACAACT GATACAAATA CCGGGACAAA TGACACGGAA ATACAAACAG GAGATAAACA 960
GACACAGGGA GGTGGCGAGC AAAGGGAAGA AGAACAGCAA GAGGTGAGTG AAACTTCAGT 1020
TATAGTTTCC AGCGTAGAAC AACCTGGTTG TAGCAACCCT GCAGAGTGTG TTGATGTTAG 1080
TGAGGCTGCT GAGAATAATG ATACAACTGA TTGCATGGCA GAAGAATGTG AAATCTCACA 1140
AGCTGAAAGT GTAGGGGACA GTATGATTGA TGAGTTGGAT GGTTTGTCAC AGTGTATGGA 1200
TGATAGTATA AGAGATGAGG AACAGTGGTC AGATGCTGCA GCAGAAAATG A 1251