EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-29333 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:9112913-9114187 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr24:9113261-9113282GAGAAGAAAGTGAAAGAGAGA-6.98
NFYAMA0060.3chr24:9112997-9113008AACCAATCAGA+6.62
NFYBMA0502.1chr24:9112992-9113007AACCCAACCAATCAG+6.97
Enhancer Sequence
CTGTTGTAAT CTAACTAAAA CCTTTGAATA TTCAATCCAT GTTGAATGTG TGTCTGCCTT 60
TAGGTGGACG GTCCAGAGGA ACCCAACCAA TCAGAAGTGC ACTGTAAGTT TCAGTCGGTC 120
GGCATTCAAG TAGAGGAAGA GAGAAGGTAT GTTTATCCAC ACCCACTCAC TCTCGCTCTC 180
TCTTTCTCTC ACTCTCTCTC TCTGTCACAC CAGAAACATA TCCCATAACA CCCACCTCCC 240
ATCATGTGCT CATACAAATA ACACAATGTA AATGAAAACA TGATACAGAT GCGAATACAG 300
TGAGTATGAA TGTTCCTGAA GAATTAAAAC TGTAACAGGA GAGAGAGAGA GAAGAAAGTG 360
AAAGAGAGAG AGAGAGAGTT GTCATTTCAA GCACATGCTC CTGTGACAAA GACACTCCCA 420
TTCTCTCTGT CTCTATTTCA CACACACAGC TGTCCCTATC ATGGTGGTTT GGACACTGGG 480
GCCTCCTGAA GGGGTGGGAG GCAGCGAGAC AGCTGCTCTG TGTGGGTGTG TATGCGGGTG 540
TTTGTACGTG CATGTGTGCG TCTGTGTGTG TGTGCGACGC ATGGCCATCT GTTGCTGTGC 600
CCATTATGAA TCAGGCAGGC TGCTGGGTCA CAGACATGGT CAAGTATCGA CCCCCTGTCT 660
CACTTCTCTC CTGCTTTCTC TGGCTCGCAC ACCCTCATAT GTCACTGTTT TAGCACCCTG 720
TGGAGAGAGG GAGGGAAATA ACCTCAGGAG GAGGTAGAGT GAAAGAGAGA GATGCTCAGT 780
GTCTGTGGGC TTTCCCTTAA AGTTCAGCCA CAGGTTCAGC CGAAGCCTCG TAAAAAACAC 840
CATCTCGTAG GGCTGTCTGG GAGTACAGAT CAAATGCCAG AACAAATGTC TTGCATTCGC 900
ACTTGCATAC TGTGTGTAAA CAGTTGTTTT ACAAAAGGTC AGTTATGTTC TAGGTCAGTT 960
GATCTGTCTG GTCCAGTGAA GTGTAAATAG AGATCCTGTG AAAGTCCAGG CTGAAAACAC 1020
AGACTGTTCA GATCCACATG GGACTTTTAT CAGGTTGTTT TCAATTATGT GGTTCTGGTG 1080
ACACGCAAAA TTCAGGGCCT ACTCACACTA TGCCATCCGT ACCGTGCCCA GGCCCGTTTC 1140
CCGGATCGTT TGAGAAGTGT GAGTGCGCTG AATCGGGCTC AAGCACGGTT CACTTGGCCA 1200
GCCCTGGCCC GTTTGGAAGA GGTGTGCCTG GGCGCGGATC ACTTGGGCTT TGGCGCGGTA 1260
CGCTTGTGTG TTAG 1274