EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-29167 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:4365129-4365587 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr24:4365342-4365358CATTGTTTACACAACA-6.1
HNF1BMA0153.2chr24:4365169-4365182ATTAATTATTTAC-6.42
Lhx3MA0135.1chr24:4365143-4365156TAATTAATTAAAC+6.19
Lhx3MA0135.1chr24:4365140-4365153AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr24:4365139-4365152AAATTAATTAATT+6.92
POU4F1MA0790.1chr24:4365168-4365182CATTAATTATTTAC-6.6
POU4F2MA0683.1chr24:4365166-4365182ATCATTAATTATTTAC-6.31
POU4F3MA0791.1chr24:4365166-4365182ATCATTAATTATTTAC-6.64
POU6F1MA0628.1chr24:4365141-4365151ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr24:4365141-4365151ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CTAGCTTTTT AAATTAATTA ATTAAACAAT TATATTTATC ATTAATTATT TACTTTTATT 60
AAATCCCTCT TTCCATCTTA AGGACTAAAA TAAACCTTTT CTTCTTCTTT TTTTCATCAC 120
CCAGTCTGTT GTATCTCCTT CCTTCAATGT AAGACTTCCC AAATCAGCCC ATGTTCCCAC 180
AATTGAGCCT TGTTGTCTTT TCATGCAAAT CACCATTGTT TACACAACAG CCCTAAGCGG 240
CGGCTGAGAC ATGGTGTCCA GAGAGAGAGG ATATGATGTT GTCAGCTGAC AGGAAGTGTG 300
ATTGGGCCAC AGATGGTTCA TTCACAGCAG AGAATGACTC AAACACAATC ACTGAAGAAA 360
TCACACACAC ATTTTTAGTT ATGATATTTG ATTTATTGAC GCTTTCAGTT CTGACAGACG 420
TGAACTGAAA GGGCCTTTTG TGTTCTAGGA TTACATTG 458