EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-29131 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr24:3500862-3503010 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr24:3502169-3502180AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr24:3502172-3502183TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr24:3502168-3502179TAATTTAATTA+6.62
PHOX2AMA0713.1chr24:3502173-3502184TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr24:3502173-3502184TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr24:3502168-3502179TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr24:3502168-3502179TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr24:3502173-3502184TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr24:3502168-3502179TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr24:3502173-3502184TAATTAAATTA-6.62
Rhox11MA0629.1chr24:3502189-3502206ACGATGCTGTAAAAGCA+6.01
SCRT1MA0743.1chr24:3502918-3502933TTGCAACAGGTGTGT+6.29
SCRT2MA0744.1chr24:3502918-3502931TTGCAACAGGTGT+6.06
Enhancer Sequence
TAGCTTCCAA GAATCCAAAA AGAGCCACAT ATTAATGAAT AATGTTATAA GAGCTGATTT 60
AACATTACAT TCTGATTGAA TAGCCTCTTG TGACAGTTAT GAAATAGTTT GATAAGCAGG 120
AAATGTTCAT GAACCACACT GAAATGGTCT CAATCATTGG TTAAACCTCA GGTAAAGTGG 180
CATGCGTTTG GGATCGGGGG GCAATTTATA ATGTGCTCGG TTTGTAAATT AATCCATTAG 240
GTGCAAATTA CTCCATAATC ACGGATCTCT ACTTCCACTA GTTGTCTTTT GTGTGTGCGT 300
CAAACCGGCG ACGTTTCCCT TTCTTTAGGT CTCTGAACCC TTTACACCGT GTGTGAAGAC 360
ACAAAGAGCA GAGATGACGC GTCACCTGCG AGCCGGATTG GGGCATTAAA AGTCGAGACC 420
CGGGGTGTCG TAATGGCACC ATTTACATTA GCATGTCACC ATTACCACAC GAAAAAACGG 480
AGCTGAATTA ACCTGTCTTT GCAATGTCAA ACCCTACTGT TTTTTCGTCC CTTATTTTGA 540
AGCTAGAGTG AAATAGAGAG AGGGAGAGAG GAAAATGAGG GCCGCATCAC TCTGACAGGA 600
CCTCTAATTG GACAGCGTGT CGGAGCTCTT CAGGGGCAGG CCATCCGGAA ACGGGCAGAT 660
AATGACAAGA CGGCGACTGC CTTTCACTTT GGCGAAGGTT AACACACACA TACACACGTC 720
TGAATGACAG TTACAGGAGA GAAAGAGAGA GATAGAGAGG TGACCATCTT TCCATCTTCT 780
GCTGTGTTTA GTAAAAGTCC CCATTTCTAT TGAGGCGAAG TTGGCTTTAT GTTCACACAT 840
TCTGACTTTC TCCTTAATAA TATAATTTCA TAAAAGTATT TTTTGCAAAT TCTGAATATG 900
GAAATCATAT TAGCAGCCAA TGAATATTAA AGTACATTGT TTAGTCAATG GGAAATATGC 960
ACACGGACTT TTAATTTGTC AGCCAGCCCC AACATAGATA TATACATATA GATATATGCA 1020
TCTATGCTCC AATACAAAAC GTCACCTTTA AGATCTGACA TCTCTAAAAA AACAGCGATC 1080
TTACAGCCTG GCTGAGATAC AATATAAAGT GTGTATCAGA CCAAACAAGA AGCACTGCAT 1140
TAAATGATAG TTTTCCCCGC CATGTCTTTA AAATAAGGAA ATTAATTTAA TTTCAGTATT 1200
TTCAATGGGG TTTTTGAGCT AGCGACTACG CCTGGATTTA AACGGATTTT CGTCTCTTTT 1260
TACACTTTAA CAACCAAATG GATGTTTAAA TATTTTTAAC TGATTATAAT TTAATTAAAT 1320
TACAACAACG ATGCTGTAAA AGCAACCTTG TTAAATTATA TAATTGTCGC ATAAACCTTT 1380
CACCGGAAGT TCTCCATTGG CTGAAAAGCT GTACATGTAG CCCATTAAAC AGTGCAAATG 1440
TTGTTTTGAA GTACTTTTTT ACACGCCATT TCAGACCCAA TAGTCAAAGT AGCGTGATAA 1500
ACAATATAGG GACTGCTAAA ATATACGAAT GTGCGAATAT AAAACCAACT CGACCTCAAT 1560
CTCATGTCAC ATTACCTCTT GTCGTTGCTG GTAAACCTTG TTCTGTCAAA AATCTCATTG 1620
TTTCCCTGCA AACTAAACCA GTGATGTGCT GCAAGGTATG TGACTTTCAG AGTCAGATTT 1680
TCATATATGC ACACAATATA ATTGCCATCT ACCGATTGTG TTTTATATCT CACATCAGCA 1740
TCCTTTTTAT ACACATATCA TTTATTTAGT GGGCCAAGGA AGAATGTAAA ATGTGCGGTT 1800
CACTATGCCT CTCAAACACC AAGGTGGACG CTGCTGACAA TAACAAGCCA CACAGCACAA 1860
CGGCGTGTGC GCGCGCGCTC TCTCATACAC ACACAGTGCT TGAACACGGG TCTTACCTTT 1920
GCTTGTAAAT GAAGTCTTGA AATTACTTGA ATTACTGAAC TGCTCGCGCT ATTTTCTTTC 1980
CTGTCATTTG AAGCAAGGCC CTTAGCTCCG GTGTTGTGCC GAGAATTGCA CCCGTGCCGT 2040
AAACTGCACC CCCAGATTGC AACAGGTGTG TTGTGCCGAG AATTGCACCT CTGCCGTAAA 2100
ATGCACCCCA TTCATTAGCA TCCTCAGTGT ATATTAAAAA AATAATAA 2148